37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2385 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_2385  hypothetical protein  100 
 
 		 177 aa  347  7e-95  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0013  hypothetical protein  48.02 
 
 		 178 aa  114  7.999999999999999e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0432449  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3569  hypothetical protein  39.55 
 
 		 157 aa  110  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0807  hypothetical protein  45.98 
 
 		 162 aa  84  0.000000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00387772 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0486  hypothetical protein  38.86 
 
 		 159 aa  75.5  0.0000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0280674  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07990  hypothetical protein  38.98 
 
 		 160 aa  73.2  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.744035  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4049  hypothetical protein  28.98 
 
 		 183 aa  70.5  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1454  hypothetical protein  39.01 
 
 		 165 aa  68.9  0.00000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.390893  normal  0.1262 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2751  hypothetical protein  33.14 
 
 		 178 aa  64.3  0.0000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0140  hypothetical protein  27.78 
 
 		 257 aa  63.9  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2867  hypothetical protein  24.73 
 
 		 255 aa  63.2  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4936  signal transduction histidine kinase (STHK), LytS  28.05 
 
 		 190 aa  60.5  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.272462 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0128  hypothetical protein  32.02 
 
 		 187 aa  59.7  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0145  hypothetical protein  31.15 
 
 		 187 aa  58.9  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3410  hypothetical protein  22.65 
 
 		 170 aa  58.9  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1077  hypothetical protein  24.86 
 
 		 255 aa  59.3  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.41011 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1181  hypothetical protein  34.15 
 
 		 184 aa  58.5  0.00000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.581092  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2568  hypothetical protein  32.39 
 
 		 421 aa  58.5  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.605817  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3235  hypothetical protein  25.73 
 
 		 182 aa  58.5  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0885199 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3611  hypothetical protein  33.71 
 
 		 281 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0202  hypothetical protein  24.46 
 
 		 172 aa  55.8  0.0000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0942  hypothetical protein  23.73 
 
 		 255 aa  55.8  0.0000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.410236  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3958  hypothetical protein  31.84 
 
 		 274 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.161528 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5578  hypothetical protein  31.64 
 
 		 198 aa  51.6  0.000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0130  hypothetical protein  21.79 
 
 		 184 aa  48.9  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.722331  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1260  hypothetical protein  24.43 
 
 		 243 aa  48.1  0.00007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0262  hypothetical protein  24.86 
 
 		 187 aa  47.8  0.00008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0872  hypothetical protein  36.84 
 
 		 201 aa  47.8  0.00009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.579086 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4299  hypothetical protein  27.43 
 
 		 201 aa  45.8  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2182  hypothetical protein  25.35 
 
 		 158 aa  45.8  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.596109  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0665  hypothetical protein  26.98 
 
 		 154 aa  45.1  0.0006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0853  signal transduction histidine kinase (STHK), LytS  31.61 
 
 		 238 aa  44.3  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.72349 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1118  hypothetical protein  40.48 
 
 		 187 aa  44.3  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000113456 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5711  hypothetical protein  39.24 
 
 		 183 aa  43.5  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.491196  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1054  putative permease  27.17 
 
 		 201 aa  43.1  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1115  hypothetical protein  28.89 
 
 		 176 aa  41.6  0.006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000737552  normal  0.471201 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5156  hypothetical protein  32.02 
 
 		 201 aa  41.2  0.007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>