14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_5711 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_5711  hypothetical protein  100 
 
 		 183 aa  367  1e-101  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.491196  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0872  hypothetical protein  28.26 
 
 		 201 aa  78.2  0.00000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.579086 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2068  hypothetical protein  40.83 
 
 		 176 aa  76.6  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0134546 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4936  signal transduction histidine kinase (STHK), LytS  30.25 
 
 		 190 aa  62.8  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.272462 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2751  hypothetical protein  35.62 
 
 		 178 aa  60.5  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2385  hypothetical protein  29.31 
 
 		 177 aa  59.7  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0202  hypothetical protein  29.37 
 
 		 172 aa  47.4  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3569  hypothetical protein  32.61 
 
 		 157 aa  46.6  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0853  signal transduction histidine kinase (STHK), LytS  28.57 
 
 		 238 aa  45.1  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.72349 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1290  hypothetical protein  31.36 
 
 		 163 aa  44.7  0.0007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000841188  hitchhiker  0.00412326 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2568  hypothetical protein  35.51 
 
 		 421 aa  43.5  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.605817  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3236  hypothetical protein  26.72 
 
 		 163 aa  43.5  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1054  putative permease  28.78 
 
 		 201 aa  43.1  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2261  hypothetical protein  25.48 
 
 		 170 aa  42.4  0.004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>