15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_3236 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_3236  hypothetical protein  100 
 
 
163 aa  330  4e-90  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4936  signal transduction histidine kinase (STHK), LytS  31.13 
 
 
190 aa  68.2  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.272462 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0853  signal transduction histidine kinase (STHK), LytS  32.53 
 
 
238 aa  55.5  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.72349 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0262  hypothetical protein  23.73 
 
 
187 aa  50.8  0.000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3235  hypothetical protein  24.56 
 
 
182 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0885199 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2751  hypothetical protein  30.41 
 
 
178 aa  46.6  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0665  hypothetical protein  30.61 
 
 
154 aa  43.9  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0595  Signal transduction histidine kinase (STHK), LytS  47.5 
 
 
425 aa  42.4  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5139  signal transduction histidine kinase LytS  52.78 
 
 
522 aa  42  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09530  hypothetical protein  28.68 
 
 
173 aa  41.2  0.007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.243649 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0130  hypothetical protein  23.12 
 
 
184 aa  40.8  0.008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.722331  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00660  hypothetical protein  37.7 
 
 
175 aa  40.8  0.008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3984  hypothetical protein  32.88 
 
 
175 aa  40.4  0.01  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4058  hypothetical protein  32.88 
 
 
175 aa  40.4  0.01  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3998  hypothetical protein  32.88 
 
 
175 aa  40.4  0.01  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.114534  normal  0.234292 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>