59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_0595 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_0595  Signal transduction histidine kinase (STHK), LytS  100 
 
 
425 aa  814    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5139  signal transduction histidine kinase LytS  64.32 
 
 
522 aa  224  2e-57  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0637  hypothetical protein  50.49 
 
 
568 aa  199  9e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4936  signal transduction histidine kinase (STHK), LytS  43.32 
 
 
190 aa  162  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.272462 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0853  signal transduction histidine kinase (STHK), LytS  47.27 
 
 
238 aa  139  7e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.72349 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3235  hypothetical protein  39.01 
 
 
182 aa  133  5e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0885199 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0130  hypothetical protein  38.92 
 
 
184 aa  128  2.0000000000000002e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.722331  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0262  hypothetical protein  40.45 
 
 
187 aa  127  5e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2751  hypothetical protein  37.5 
 
 
178 aa  89  1e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3569  hypothetical protein  36.21 
 
 
157 aa  84.3  0.000000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2568  hypothetical protein  38.46 
 
 
421 aa  78.6  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.605817  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3236  hypothetical protein  32.52 
 
 
163 aa  78.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4049  hypothetical protein  35.12 
 
 
183 aa  75.9  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2867  hypothetical protein  28 
 
 
255 aa  74.7  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2385  hypothetical protein  33.69 
 
 
177 aa  74.7  0.000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0140  hypothetical protein  30.18 
 
 
257 aa  72.8  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1077  hypothetical protein  30.26 
 
 
255 aa  72.4  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.41011 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1181  hypothetical protein  42.04 
 
 
184 aa  70.9  0.00000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.581092  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1115  hypothetical protein  31.02 
 
 
176 aa  70.9  0.00000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000737552  normal  0.471201 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0202  hypothetical protein  31.06 
 
 
172 aa  70.1  0.00000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0128  hypothetical protein  39.38 
 
 
187 aa  69.7  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0145  hypothetical protein  38.75 
 
 
187 aa  69.3  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1454  hypothetical protein  36.57 
 
 
165 aa  67  0.0000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.390893  normal  0.1262 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0942  hypothetical protein  27.7 
 
 
255 aa  67  0.0000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.410236  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0555  hypothetical protein  29.05 
 
 
183 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.913643 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4263  hypothetical protein  42.68 
 
 
176 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000926543 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4299  hypothetical protein  41.56 
 
 
201 aa  62  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1075  hypothetical protein  41.67 
 
 
176 aa  61.2  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.072319999999999e-49 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1093  hypothetical protein  41.67 
 
 
176 aa  61.2  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.583723  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07990  hypothetical protein  33.53 
 
 
160 aa  61.2  0.00000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.744035  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0902  hypothetical protein  42.31 
 
 
176 aa  61.2  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0999  hypothetical protein  41.94 
 
 
176 aa  60.5  0.00000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.326101  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0934  hypothetical protein  41.94 
 
 
176 aa  60.5  0.00000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0919  hypothetical protein  42.31 
 
 
176 aa  60.1  0.00000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2182  hypothetical protein  31.39 
 
 
158 aa  60.1  0.00000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.596109  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3824  hypothetical protein  29.75 
 
 
183 aa  60.1  0.00000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1040  hypothetical protein  41.67 
 
 
176 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1166  hypothetical protein  41.03 
 
 
176 aa  57.8  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0807  hypothetical protein  35.71 
 
 
162 aa  55.8  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00387772 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2068  hypothetical protein  30.26 
 
 
176 aa  55.5  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0134546 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1054  putative permease  29.83 
 
 
201 aa  55.5  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0910  hypothetical protein  41.03 
 
 
176 aa  55.5  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4729  hypothetical protein  39.38 
 
 
204 aa  54.3  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5156  hypothetical protein  40.49 
 
 
201 aa  53.1  0.000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3792  hypothetical protein  36.48 
 
 
172 aa  52  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0736619 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3410  hypothetical protein  25.14 
 
 
170 aa  51.6  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0486  hypothetical protein  33.53 
 
 
159 aa  50.8  0.00004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0280674  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1071  hypothetical protein  32.65 
 
 
164 aa  50.1  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.223632 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3958  hypothetical protein  38.79 
 
 
274 aa  49.7  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.161528 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0665  hypothetical protein  29.03 
 
 
154 aa  47.4  0.0005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4780  hypothetical protein  42.68 
 
 
194 aa  47.4  0.0005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.242814  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3611  hypothetical protein  46.59 
 
 
281 aa  45.8  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1118  hypothetical protein  36.41 
 
 
187 aa  46.6  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  unclonable  0.0000113456 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5131  putative transmembrane protein  31.58 
 
 
171 aa  44.7  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2701  hypothetical protein  26.09 
 
 
169 aa  44.7  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2700  hypothetical protein  26.09 
 
 
169 aa  44.7  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2777  hypothetical protein  39.02 
 
 
168 aa  44.7  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3645  putative transmembrane protein  25.41 
 
 
198 aa  43.9  0.005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0430  hypothetical protein  27.88 
 
 
266 aa  43.9  0.006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.886094  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>