27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3792 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_3792  hypothetical protein  100 
 
 
172 aa  330  6e-90  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0736619 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0853  signal transduction histidine kinase (STHK), LytS  36.65 
 
 
238 aa  73.2  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.72349 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4936  signal transduction histidine kinase (STHK), LytS  31.58 
 
 
190 aa  67.4  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.272462 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4049  hypothetical protein  34.19 
 
 
183 aa  65.9  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0128  hypothetical protein  33.12 
 
 
187 aa  62.8  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0145  hypothetical protein  33.33 
 
 
187 aa  62  0.000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3235  hypothetical protein  29.17 
 
 
182 aa  60.8  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0885199 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2751  hypothetical protein  31.88 
 
 
178 aa  60.1  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1454  hypothetical protein  32.91 
 
 
165 aa  53.5  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.390893  normal  0.1262 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3569  hypothetical protein  33.55 
 
 
157 aa  51.6  0.000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5139  signal transduction histidine kinase LytS  33.33 
 
 
522 aa  51.2  0.000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0595  Signal transduction histidine kinase (STHK), LytS  36.48 
 
 
425 aa  49.7  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0807  hypothetical protein  36.75 
 
 
162 aa  49.3  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00387772 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4299  hypothetical protein  34.04 
 
 
201 aa  48.1  0.00006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07990  hypothetical protein  36.17 
 
 
160 aa  48.1  0.00006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.744035  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3236  hypothetical protein  26.25 
 
 
163 aa  47  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2568  hypothetical protein  31.41 
 
 
421 aa  46.6  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.605817  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0130  hypothetical protein  24.69 
 
 
184 aa  45.4  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.722331  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4729  hypothetical protein  37.84 
 
 
204 aa  45.1  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2700  hypothetical protein  33.94 
 
 
169 aa  45.1  0.0005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2701  hypothetical protein  33.94 
 
 
169 aa  44.7  0.0006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3611  hypothetical protein  44.3 
 
 
281 aa  44.7  0.0007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1115  hypothetical protein  26.92 
 
 
176 aa  43.1  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000737552  normal  0.471201 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4780  hypothetical protein  33.33 
 
 
194 aa  42.4  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.242814  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5156  hypothetical protein  35.62 
 
 
201 aa  42  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1054  putative permease  31.08 
 
 
201 aa  41.2  0.008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2182  hypothetical protein  27.01 
 
 
158 aa  40.8  0.009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.596109  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>