33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_2700 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_2700  hypothetical protein  100 
 
 
169 aa  332  2e-90  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2701  hypothetical protein  99.41 
 
 
169 aa  329  1e-89  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2777  hypothetical protein  63.91 
 
 
168 aa  226  2e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1303  hypothetical protein  58.58 
 
 
169 aa  204  6e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0159  hypothetical protein  58.58 
 
 
169 aa  204  6e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0134  hypothetical protein  58.58 
 
 
169 aa  204  6e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2640  hypothetical protein  58.58 
 
 
169 aa  203  1e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2782  hypothetical protein  58.58 
 
 
169 aa  203  1e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1044  hypothetical protein  58.58 
 
 
357 aa  202  2e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0430  hypothetical protein  56.8 
 
 
266 aa  197  5e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.886094  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2271  putative transmembrane protein  57.99 
 
 
169 aa  189  1e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6432  hypothetical protein  52.07 
 
 
169 aa  186  2e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.367117  normal  0.177925 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5934  hypothetical protein  50.3 
 
 
169 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.476639 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6207  hypothetical protein  50.3 
 
 
169 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0061  hypothetical protein  55.03 
 
 
283 aa  168  4e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7364  hypothetical protein  50.89 
 
 
169 aa  166  1e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.412061 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0214  hypothetical protein  45.83 
 
 
170 aa  155  2e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000429039 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0195  putative transmembrane protein  44.64 
 
 
170 aa  154  8e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.386415  normal  0.4903 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3645  putative transmembrane protein  38.78 
 
 
198 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0339  hypothetical protein  46.75 
 
 
171 aa  135  2e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5876  hypothetical protein  43.45 
 
 
170 aa  135  3.0000000000000003e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5395  transmembrane protein  45.24 
 
 
170 aa  135  3.0000000000000003e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4312  putative transmembrane protein  44.38 
 
 
171 aa  132  1.9999999999999998e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5131  putative transmembrane protein  40.24 
 
 
171 aa  132  3e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0724  putative transmembrane protein  37.28 
 
 
171 aa  119  3e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.618067  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1460  hypothetical protein  26.88 
 
 
193 aa  71.6  0.000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.116016  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2068  hypothetical protein  26.76 
 
 
182 aa  55.1  0.0000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17980  hypothetical protein  21.18 
 
 
190 aa  52.8  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49910  hypothetical protein  25.56 
 
 
227 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.416187 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1054  putative permease  34.31 
 
 
201 aa  43.5  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1165  hypothetical protein  18.82 
 
 
185 aa  43.1  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.712882  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0725  hypothetical protein  22.22 
 
 
202 aa  43.1  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0140  hypothetical protein  25.97 
 
 
257 aa  41.2  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>