24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_17980 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_17980  hypothetical protein  100 
 
 
190 aa  389  1e-107  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1165  hypothetical protein  51.69 
 
 
185 aa  191  5e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.712882  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49910  hypothetical protein  57.83 
 
 
227 aa  180  1e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.416187 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4251  hypothetical protein  53.3 
 
 
184 aa  175  5e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0725  hypothetical protein  39.89 
 
 
202 aa  137  7.999999999999999e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1460  hypothetical protein  31.28 
 
 
193 aa  97.4  1e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.116016  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2700  hypothetical protein  21.18 
 
 
169 aa  52.8  0.000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2701  hypothetical protein  21.18 
 
 
169 aa  52.4  0.000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2068  hypothetical protein  24.39 
 
 
182 aa  52  0.000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0430  hypothetical protein  26.16 
 
 
266 aa  51.6  0.000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.886094  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6432  hypothetical protein  23.21 
 
 
169 aa  50.1  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.367117  normal  0.177925 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1044  hypothetical protein  25.58 
 
 
357 aa  47.8  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0195  putative transmembrane protein  23.81 
 
 
170 aa  47.8  0.00009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.386415  normal  0.4903 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2782  hypothetical protein  22.94 
 
 
169 aa  47.4  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2640  hypothetical protein  22.94 
 
 
169 aa  47.4  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0214  hypothetical protein  23.21 
 
 
170 aa  47.4  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000429039 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6207  hypothetical protein  22.22 
 
 
169 aa  47  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5934  hypothetical protein  22.22 
 
 
169 aa  47  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.476639 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1303  hypothetical protein  24.56 
 
 
169 aa  44.7  0.0007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0159  hypothetical protein  24.56 
 
 
169 aa  44.7  0.0007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0134  hypothetical protein  24.56 
 
 
169 aa  44.7  0.0007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7364  hypothetical protein  23.21 
 
 
169 aa  42.4  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.412061 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4312  putative transmembrane protein  24.4 
 
 
171 aa  42.7  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2271  putative transmembrane protein  24.71 
 
 
169 aa  42  0.005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>