33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_0195 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_0195  putative transmembrane protein  100 
 
 		 170 aa  342  1e-93  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.386415  normal  0.4903 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0214  hypothetical protein  96.47 
 
 		 170 aa  337  5e-92  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000429039 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0339  hypothetical protein  86.55 
 
 		 171 aa  280  7.000000000000001e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5876  hypothetical protein  62.35 
 
 		 170 aa  216  2e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5395  transmembrane protein  61.76 
 
 		 170 aa  209  1e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5131  putative transmembrane protein  52.05 
 
 		 171 aa  201  6e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4312  putative transmembrane protein  63.74 
 
 		 171 aa  198  3e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3645  putative transmembrane protein  48.99 
 
 		 198 aa  196  1.0000000000000001e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0724  putative transmembrane protein  53.8 
 
 		 171 aa  174  5e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.618067  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2700  hypothetical protein  44.64 
 
 		 169 aa  154  8e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2777  hypothetical protein  47.06 
 
 		 168 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2701  hypothetical protein  44.05 
 
 		 169 aa  152  2.9999999999999998e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6432  hypothetical protein  44.91 
 
 		 169 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.367117  normal  0.177925 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2782  hypothetical protein  47.31 
 
 		 169 aa  143  1e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2640  hypothetical protein  47.31 
 
 		 169 aa  143  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0134  hypothetical protein  47.31 
 
 		 169 aa  142  2e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5934  hypothetical protein  44.44 
 
 		 169 aa  142  2e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.476639 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6207  hypothetical protein  44.44 
 
 		 169 aa  142  2e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0159  hypothetical protein  47.31 
 
 		 169 aa  142  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1303  hypothetical protein  47.31 
 
 		 169 aa  142  2e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1044  hypothetical protein  46.47 
 
 		 357 aa  141  5e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2271  putative transmembrane protein  44.05 
 
 		 169 aa  139  9.999999999999999e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0430  hypothetical protein  45.29 
 
 		 266 aa  138  3e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.886094  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7364  hypothetical protein  45.03 
 
 		 169 aa  130  9e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.412061 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0061  hypothetical protein  46.11 
 
 		 283 aa  123  1e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1460  hypothetical protein  29.56 
 
 		 193 aa  73.6  0.000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.116016  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1165  hypothetical protein  27.98 
 
 		 185 aa  67.8  0.00000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.712882  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2068  hypothetical protein  30.61 
 
 		 182 aa  50.1  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17980  hypothetical protein  23.81 
 
 		 190 aa  47.8  0.00007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4251  hypothetical protein  26.83 
 
 		 184 aa  44.3  0.0007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49910  hypothetical protein  25.9 
 
 		 227 aa  42.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.416187 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0725  hypothetical protein  21.84 
 
 		 202 aa  43.1  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04114  hypothetical protein  29.17 
 
 		 72 aa  40.4  0.01  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>