33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_5876 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_5876  hypothetical protein  100 
 
 		 170 aa  337  4e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5395  transmembrane protein  91.18 
 
 		 170 aa  283  8e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0214  hypothetical protein  62.35 
 
 		 170 aa  239  1e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000429039 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0195  putative transmembrane protein  62.35 
 
 		 170 aa  239  2e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.386415  normal  0.4903 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0339  hypothetical protein  67.25 
 
 		 171 aa  221  4e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4312  putative transmembrane protein  66.67 
 
 		 171 aa  216  2e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3645  putative transmembrane protein  56.06 
 
 		 198 aa  215  2e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5131  putative transmembrane protein  59.65 
 
 		 171 aa  213  9.999999999999999e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0724  putative transmembrane protein  57.31 
 
 		 171 aa  191  6e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.618067  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2777  hypothetical protein  47.02 
 
 		 168 aa  151  4e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2700  hypothetical protein  43.45 
 
 		 169 aa  150  8.999999999999999e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2701  hypothetical protein  42.86 
 
 		 169 aa  148  3e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2271  putative transmembrane protein  47.02 
 
 		 169 aa  146  1.0000000000000001e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2782  hypothetical protein  46.43 
 
 		 169 aa  145  3e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2640  hypothetical protein  46.43 
 
 		 169 aa  145  3e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1044  hypothetical protein  46.43 
 
 		 357 aa  144  5e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0430  hypothetical protein  45.83 
 
 		 266 aa  143  1e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.886094  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0134  hypothetical protein  45.83 
 
 		 169 aa  143  1e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1303  hypothetical protein  45.83 
 
 		 169 aa  143  1e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0159  hypothetical protein  45.83 
 
 		 169 aa  143  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6432  hypothetical protein  42.86 
 
 		 169 aa  137  4.999999999999999e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.367117  normal  0.177925 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5934  hypothetical protein  41.67 
 
 		 169 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.476639 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6207  hypothetical protein  41.67 
 
 		 169 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0061  hypothetical protein  44.05 
 
 		 283 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7364  hypothetical protein  41.07 
 
 		 169 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.412061 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1460  hypothetical protein  32.08 
 
 		 193 aa  79.3  0.00000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.116016  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49910  hypothetical protein  30.07 
 
 		 227 aa  54.7  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.416187 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1165  hypothetical protein  22.81 
 
 		 185 aa  54.3  0.0000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.712882  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4251  hypothetical protein  29.08 
 
 		 184 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2068  hypothetical protein  27.89 
 
 		 182 aa  50.4  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04114  hypothetical protein  34.78 
 
 		 72 aa  48.1  0.00006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17980  hypothetical protein  22.49 
 
 		 190 aa  48.1  0.00006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0725  hypothetical protein  22.89 
 
 		 202 aa  43.1  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>