32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_A2640 on replicon NC_009078
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007435  BURPS1710b_A1044  hypothetical protein  100 
 
 
357 aa  337  4e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2782  hypothetical protein  100 
 
 
169 aa  336  9e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2640  hypothetical protein  100 
 
 
169 aa  336  9e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1303  hypothetical protein  98.82 
 
 
169 aa  332  2e-90  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0134  hypothetical protein  98.82 
 
 
169 aa  332  2e-90  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0159  hypothetical protein  98.82 
 
 
169 aa  332  2e-90  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0430  hypothetical protein  93.49 
 
 
266 aa  300  9e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.886094  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0061  hypothetical protein  74.56 
 
 
283 aa  219  9.999999999999999e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2700  hypothetical protein  58.58 
 
 
169 aa  219  1.9999999999999999e-56  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2701  hypothetical protein  57.99 
 
 
169 aa  217  7e-56  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2777  hypothetical protein  58.58 
 
 
168 aa  209  1e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6432  hypothetical protein  62.13 
 
 
169 aa  206  2e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.367117  normal  0.177925 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5934  hypothetical protein  58.58 
 
 
169 aa  199  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.476639 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6207  hypothetical protein  58.58 
 
 
169 aa  199  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7364  hypothetical protein  58.58 
 
 
169 aa  184  4e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.412061 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2271  putative transmembrane protein  57.4 
 
 
169 aa  178  2.9999999999999997e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0214  hypothetical protein  47.31 
 
 
170 aa  155  2e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000429039 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0195  putative transmembrane protein  47.31 
 
 
170 aa  154  4e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.386415  normal  0.4903 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3645  putative transmembrane protein  41.84 
 
 
198 aa  145  3e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4312  putative transmembrane protein  49.7 
 
 
171 aa  143  1e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5876  hypothetical protein  46.43 
 
 
170 aa  140  9e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5395  transmembrane protein  45.83 
 
 
170 aa  135  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0339  hypothetical protein  46.43 
 
 
171 aa  134  6.0000000000000005e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5131  putative transmembrane protein  40.83 
 
 
171 aa  133  9.999999999999999e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0724  putative transmembrane protein  40.83 
 
 
171 aa  131  3.9999999999999996e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.618067  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1460  hypothetical protein  27.78 
 
 
193 aa  70.9  0.000000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.116016  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2068  hypothetical protein  30.56 
 
 
182 aa  59.3  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17980  hypothetical protein  22.94 
 
 
190 aa  50.8  0.000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1165  hypothetical protein  23.39 
 
 
185 aa  48.1  0.00006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.712882  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0725  hypothetical protein  24.85 
 
 
202 aa  47.8  0.00008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49910  hypothetical protein  27.17 
 
 
227 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.416187 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4251  hypothetical protein  26.04 
 
 
184 aa  41.2  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>