27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A3645 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A3645  putative transmembrane protein  100 
 
 		 198 aa  384  1e-106  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4312  putative transmembrane protein  59.6 
 
 		 171 aa  218  3.9999999999999997e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5131  putative transmembrane protein  55.05 
 
 		 171 aa  217  7e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5876  hypothetical protein  56.06 
 
 		 170 aa  199  1.9999999999999998e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0214  hypothetical protein  49.49 
 
 		 170 aa  197  9e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000429039 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0195  putative transmembrane protein  48.99 
 
 		 170 aa  196  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.386415  normal  0.4903 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5395  transmembrane protein  54.55 
 
 		 170 aa  191  8e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0339  hypothetical protein  54.27 
 
 		 171 aa  185  4e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0724  putative transmembrane protein  51.52 
 
 		 171 aa  183  1.0000000000000001e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.618067  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2700  hypothetical protein  38.78 
 
 		 169 aa  139  3e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2701  hypothetical protein  38.27 
 
 		 169 aa  137  1e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2777  hypothetical protein  39.2 
 
 		 168 aa  135  5e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1303  hypothetical protein  40.5 
 
 		 169 aa  134  8e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0159  hypothetical protein  40.5 
 
 		 169 aa  134  8e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2640  hypothetical protein  40.5 
 
 		 169 aa  134  8e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2782  hypothetical protein  40.5 
 
 		 169 aa  134  8e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0134  hypothetical protein  40.5 
 
 		 169 aa  134  8e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1044  hypothetical protein  40.5 
 
 		 357 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0430  hypothetical protein  40 
 
 		 266 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.886094  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2271  putative transmembrane protein  38.27 
 
 		 169 aa  131  5e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6207  hypothetical protein  39 
 
 		 169 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5934  hypothetical protein  39 
 
 		 169 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.476639 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6432  hypothetical protein  39.29 
 
 		 169 aa  125  5e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.367117  normal  0.177925 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0061  hypothetical protein  38.78 
 
 		 283 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7364  hypothetical protein  39.5 
 
 		 169 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.412061 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1460  hypothetical protein  24.47 
 
 		 193 aa  61.6  0.000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.116016  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1165  hypothetical protein  25.13 
 
 		 185 aa  52  0.000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.712882  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>