26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_1165 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_1165  hypothetical protein  100 
 
 		 185 aa  383  1e-106  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.712882  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17980  hypothetical protein  51.69 
 
 		 190 aa  191  5e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0725  hypothetical protein  41.08 
 
 		 202 aa  153  1e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4251  hypothetical protein  44.69 
 
 		 184 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49910  hypothetical protein  46.06 
 
 		 227 aa  144  9e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.416187 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1460  hypothetical protein  26.11 
 
 		 193 aa  72.4  0.000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.116016  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0214  hypothetical protein  28.57 
 
 		 170 aa  69.3  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000429039 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0195  putative transmembrane protein  27.98 
 
 		 170 aa  67.8  0.00000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.386415  normal  0.4903 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6432  hypothetical protein  26.19 
 
 		 169 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.367117  normal  0.177925 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6207  hypothetical protein  26.74 
 
 		 169 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5934  hypothetical protein  26.74 
 
 		 169 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.476639 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4312  putative transmembrane protein  25 
 
 		 171 aa  58.9  0.00000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7364  hypothetical protein  27.17 
 
 		 169 aa  53.9  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.412061 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5131  putative transmembrane protein  26.32 
 
 		 171 aa  53.1  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0724  putative transmembrane protein  25.29 
 
 		 171 aa  52.8  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.618067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3645  putative transmembrane protein  25.13 
 
 		 198 aa  52  0.000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5876  hypothetical protein  22.81 
 
 		 170 aa  50.8  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0339  hypothetical protein  26.63 
 
 		 171 aa  50.4  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2068  hypothetical protein  26.67 
 
 		 182 aa  49.7  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2777  hypothetical protein  24.83 
 
 		 168 aa  48.9  0.00005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2782  hypothetical protein  23.39 
 
 		 169 aa  43.5  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2640  hypothetical protein  23.39 
 
 		 169 aa  43.5  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2700  hypothetical protein  18.82 
 
 		 169 aa  43.1  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0430  hypothetical protein  22.81 
 
 		 266 aa  42.4  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.886094  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2701  hypothetical protein  18.82 
 
 		 169 aa  42.4  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1044  hypothetical protein  23.39 
 
 		 357 aa  42  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>