27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_4251 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_4251  hypothetical protein  100 
 
 
184 aa  377  1e-104  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49910  hypothetical protein  89.53 
 
 
227 aa  289  2e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.416187 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17980  hypothetical protein  53.3 
 
 
190 aa  213  1.9999999999999998e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1165  hypothetical protein  44.69 
 
 
185 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.712882  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0725  hypothetical protein  42.33 
 
 
202 aa  131  5e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1460  hypothetical protein  28.97 
 
 
193 aa  79.7  0.00000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.116016  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2068  hypothetical protein  26.59 
 
 
182 aa  57.8  0.00000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0214  hypothetical protein  26.83 
 
 
170 aa  54.3  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000429039 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0195  putative transmembrane protein  26.83 
 
 
170 aa  53.9  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.386415  normal  0.4903 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6207  hypothetical protein  26.29 
 
 
169 aa  53.1  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5934  hypothetical protein  26.29 
 
 
169 aa  53.1  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.476639 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6432  hypothetical protein  26.67 
 
 
169 aa  51.6  0.000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.367117  normal  0.177925 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5876  hypothetical protein  27.88 
 
 
170 aa  51.6  0.000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2777  hypothetical protein  27.27 
 
 
168 aa  50.4  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2701  hypothetical protein  24.57 
 
 
169 aa  50.4  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2700  hypothetical protein  24.85 
 
 
169 aa  50.1  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0724  putative transmembrane protein  27.85 
 
 
171 aa  49.7  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.618067  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2271  putative transmembrane protein  28.66 
 
 
169 aa  48.1  0.00006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4312  putative transmembrane protein  28.66 
 
 
171 aa  46.6  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3645  putative transmembrane protein  26.23 
 
 
198 aa  45.8  0.0004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7364  hypothetical protein  24.26 
 
 
169 aa  45.1  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.412061 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5131  putative transmembrane protein  27.04 
 
 
171 aa  44.3  0.0009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0430  hypothetical protein  25.29 
 
 
266 aa  43.1  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.886094  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1044  hypothetical protein  26.47 
 
 
357 aa  42  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2640  hypothetical protein  26.47 
 
 
169 aa  41.2  0.008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2782  hypothetical protein  26.47 
 
 
169 aa  41.2  0.008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5395  transmembrane protein  26.06 
 
 
170 aa  41.2  0.009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>