31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_4312 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_4312  putative transmembrane protein  100 
 
 		 171 aa  341  2.9999999999999997e-93  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3645  putative transmembrane protein  59.6 
 
 		 198 aa  236  1e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0214  hypothetical protein  64.33 
 
 		 170 aa  219  9.999999999999999e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000429039 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0195  putative transmembrane protein  63.74 
 
 		 170 aa  219  1.9999999999999999e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.386415  normal  0.4903 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5876  hypothetical protein  66.67 
 
 		 170 aa  218  3.9999999999999997e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5395  transmembrane protein  66.67 
 
 		 170 aa  211  3.9999999999999995e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5131  putative transmembrane protein  59.65 
 
 		 171 aa  211  4.9999999999999996e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0339  hypothetical protein  67.44 
 
 		 171 aa  209  1e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0724  putative transmembrane protein  56.73 
 
 		 171 aa  191  5e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.618067  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2777  hypothetical protein  47.93 
 
 		 168 aa  154  7e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2700  hypothetical protein  44.97 
 
 		 169 aa  150  8e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2782  hypothetical protein  49.7 
 
 		 169 aa  150  8e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2640  hypothetical protein  49.7 
 
 		 169 aa  150  8e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0134  hypothetical protein  49.7 
 
 		 169 aa  150  1e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1303  hypothetical protein  49.7 
 
 		 169 aa  150  1e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0159  hypothetical protein  49.7 
 
 		 169 aa  150  1e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2271  putative transmembrane protein  49.11 
 
 		 169 aa  149  2e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1044  hypothetical protein  49.7 
 
 		 357 aa  149  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2701  hypothetical protein  44.38 
 
 		 169 aa  148  3e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0430  hypothetical protein  49.11 
 
 		 266 aa  148  4e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.886094  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6432  hypothetical protein  46.75 
 
 		 169 aa  142  3e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.367117  normal  0.177925 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6207  hypothetical protein  46.75 
 
 		 169 aa  142  3e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5934  hypothetical protein  46.75 
 
 		 169 aa  142  3e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.476639 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0061  hypothetical protein  45.56 
 
 		 283 aa  138  3.9999999999999997e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7364  hypothetical protein  47.93 
 
 		 169 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.412061 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1460  hypothetical protein  28.4 
 
 		 193 aa  77.4  0.0000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.116016  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1165  hypothetical protein  26.04 
 
 		 185 aa  67.4  0.00000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.712882  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17980  hypothetical protein  26.47 
 
 		 190 aa  53.9  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2068  hypothetical protein  25.87 
 
 		 182 aa  51.6  0.000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49910  hypothetical protein  28.57 
 
 		 227 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.416187 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4251  hypothetical protein  27.04 
 
 		 184 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>