30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_6432 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010625  Bphy_6432  hypothetical protein  100 
 
 
169 aa  334  3.9999999999999995e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.367117  normal  0.177925 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6207  hypothetical protein  78.7 
 
 
169 aa  272  2.0000000000000002e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5934  hypothetical protein  78.7 
 
 
169 aa  272  2.0000000000000002e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.476639 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7364  hypothetical protein  79.88 
 
 
169 aa  256  8e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.412061 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2782  hypothetical protein  62.13 
 
 
169 aa  191  6e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2640  hypothetical protein  62.13 
 
 
169 aa  191  6e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0134  hypothetical protein  61.54 
 
 
169 aa  189  2e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0159  hypothetical protein  61.54 
 
 
169 aa  189  2e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1044  hypothetical protein  62.13 
 
 
357 aa  189  2e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1303  hypothetical protein  61.54 
 
 
169 aa  189  2e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0430  hypothetical protein  60.95 
 
 
266 aa  187  7e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.886094  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2700  hypothetical protein  52.07 
 
 
169 aa  186  2e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2701  hypothetical protein  52.07 
 
 
169 aa  185  3e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2777  hypothetical protein  50.3 
 
 
168 aa  171  3.9999999999999995e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0061  hypothetical protein  61.54 
 
 
283 aa  169  1e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2271  putative transmembrane protein  54.44 
 
 
169 aa  169  2e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0214  hypothetical protein  44.91 
 
 
170 aa  147  7e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000429039 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0195  putative transmembrane protein  44.91 
 
 
170 aa  146  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.386415  normal  0.4903 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5131  putative transmembrane protein  42.6 
 
 
171 aa  127  6e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0724  putative transmembrane protein  40.24 
 
 
171 aa  127  7.000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.618067  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3645  putative transmembrane protein  39.29 
 
 
198 aa  125  3e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4312  putative transmembrane protein  46.75 
 
 
171 aa  125  3e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0339  hypothetical protein  45.24 
 
 
171 aa  124  5e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5876  hypothetical protein  42.86 
 
 
170 aa  124  8.000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5395  transmembrane protein  41.07 
 
 
170 aa  117  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1165  hypothetical protein  26.19 
 
 
185 aa  63.9  0.0000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.712882  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1460  hypothetical protein  28.92 
 
 
193 aa  62  0.000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.116016  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2068  hypothetical protein  29.78 
 
 
182 aa  55.8  0.0000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17980  hypothetical protein  23.21 
 
 
190 aa  50.1  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4251  hypothetical protein  24.26 
 
 
184 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>