33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_0724 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_0724  putative transmembrane protein  100 
 
 		 171 aa  342  1e-93  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.618067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3645  putative transmembrane protein  51.52 
 
 		 198 aa  200  9e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5131  putative transmembrane protein  52.05 
 
 		 171 aa  196  1.0000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0214  hypothetical protein  54.39 
 
 		 170 aa  193  1e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000429039 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0195  putative transmembrane protein  53.22 
 
 		 170 aa  190  9e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.386415  normal  0.4903 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5876  hypothetical protein  57.31 
 
 		 170 aa  187  5.999999999999999e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4312  putative transmembrane protein  56.73 
 
 		 171 aa  185  3e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5395  transmembrane protein  53.22 
 
 		 170 aa  175  2e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0339  hypothetical protein  53.49 
 
 		 171 aa  165  2.9999999999999998e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2777  hypothetical protein  44.97 
 
 		 168 aa  140  9e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0430  hypothetical protein  44.38 
 
 		 266 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.886094  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6432  hypothetical protein  42.01 
 
 		 169 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.367117  normal  0.177925 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2782  hypothetical protein  43.2 
 
 		 169 aa  138  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2640  hypothetical protein  43.2 
 
 		 169 aa  138  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0134  hypothetical protein  43.2 
 
 		 169 aa  137  7e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6207  hypothetical protein  42.01 
 
 		 169 aa  137  7e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5934  hypothetical protein  42.01 
 
 		 169 aa  137  7e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.476639 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1303  hypothetical protein  43.2 
 
 		 169 aa  137  7e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0159  hypothetical protein  43.2 
 
 		 169 aa  137  7e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1044  hypothetical protein  43.2 
 
 		 357 aa  137  8.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2700  hypothetical protein  39.64 
 
 		 169 aa  134  9e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2701  hypothetical protein  39.64 
 
 		 169 aa  132  1.9999999999999998e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2271  putative transmembrane protein  43.2 
 
 		 169 aa  128  3e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7364  hypothetical protein  41.42 
 
 		 169 aa  127  8.000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.412061 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0061  hypothetical protein  43.2 
 
 		 283 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1460  hypothetical protein  26.25 
 
 		 193 aa  71.2  0.000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.116016  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1165  hypothetical protein  26.47 
 
 		 185 aa  63.2  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.712882  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49910  hypothetical protein  29.27 
 
 		 227 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.416187 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2068  hypothetical protein  24.14 
 
 		 182 aa  53.1  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0725  hypothetical protein  27.08 
 
 		 202 aa  48.1  0.00006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4251  hypothetical protein  29.66 
 
 		 184 aa  44.7  0.0006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17980  hypothetical protein  22.7 
 
 		 190 aa  43.5  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04114  hypothetical protein  36 
 
 		 72 aa  43.1  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>