27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_0725 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_0725  hypothetical protein  100 
 
 		 202 aa  417  1e-116  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1165  hypothetical protein  41.08 
 
 		 185 aa  161  5.0000000000000005e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.712882  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17980  hypothetical protein  39.89 
 
 		 190 aa  147  8e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49910  hypothetical protein  41.46 
 
 		 227 aa  129  3e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.416187 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4251  hypothetical protein  42.33 
 
 		 184 aa  119  3e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5934  hypothetical protein  26.14 
 
 		 169 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.476639 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6207  hypothetical protein  26.14 
 
 		 169 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2777  hypothetical protein  25.15 
 
 		 168 aa  54.7  0.0000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1460  hypothetical protein  21.6 
 
 		 193 aa  53.5  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.116016  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0214  hypothetical protein  25.3 
 
 		 170 aa  52  0.000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000429039 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7364  hypothetical protein  25.75 
 
 		 169 aa  51.2  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.412061 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0195  putative transmembrane protein  26.59 
 
 		 170 aa  50.1  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.386415  normal  0.4903 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0430  hypothetical protein  23.95 
 
 		 266 aa  49.7  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.886094  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2701  hypothetical protein  25.29 
 
 		 169 aa  46.6  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2700  hypothetical protein  25.29 
 
 		 169 aa  46.6  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1044  hypothetical protein  24.4 
 
 		 357 aa  46.6  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0724  putative transmembrane protein  24.55 
 
 		 171 aa  46.2  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.618067  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5131  putative transmembrane protein  18.75 
 
 		 171 aa  46.2  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2782  hypothetical protein  24.57 
 
 		 169 aa  45.8  0.0005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2640  hypothetical protein  24.57 
 
 		 169 aa  45.8  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3645  putative transmembrane protein  22.4 
 
 		 198 aa  44.7  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0159  hypothetical protein  24 
 
 		 169 aa  43.5  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0134  hypothetical protein  24 
 
 		 169 aa  43.5  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1303  hypothetical protein  24 
 
 		 169 aa  43.5  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2261  hypothetical protein  22.56 
 
 		 170 aa  43.5  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0061  hypothetical protein  26.67 
 
 		 283 aa  43.5  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5876  hypothetical protein  26.39 
 
 		 170 aa  41.6  0.007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>