33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_0214 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_0214  hypothetical protein  100 
 
 		 170 aa  343  5e-94  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000429039 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0195  putative transmembrane protein  96.47 
 
 		 170 aa  337  5e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.386415  normal  0.4903 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0339  hypothetical protein  87.72 
 
 		 171 aa  283  1.0000000000000001e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5876  hypothetical protein  62.35 
 
 		 170 aa  217  7e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5395  transmembrane protein  62.35 
 
 		 170 aa  208  3e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5131  putative transmembrane protein  53.22 
 
 		 171 aa  203  8e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4312  putative transmembrane protein  64.33 
 
 		 171 aa  199  9.999999999999999e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3645  putative transmembrane protein  49.49 
 
 		 198 aa  197  6e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0724  putative transmembrane protein  54.97 
 
 		 171 aa  176  1e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.618067  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2700  hypothetical protein  45.83 
 
 		 169 aa  155  2e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2777  hypothetical protein  48.24 
 
 		 168 aa  154  7e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2701  hypothetical protein  45.24 
 
 		 169 aa  153  9e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6432  hypothetical protein  44.91 
 
 		 169 aa  147  7e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.367117  normal  0.177925 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2640  hypothetical protein  47.31 
 
 		 169 aa  144  5e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2782  hypothetical protein  47.31 
 
 		 169 aa  144  5e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0134  hypothetical protein  47.31 
 
 		 169 aa  144  6e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0159  hypothetical protein  47.31 
 
 		 169 aa  144  6e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1303  hypothetical protein  47.31 
 
 		 169 aa  144  6e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5934  hypothetical protein  44.44 
 
 		 169 aa  143  1e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.476639 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1044  hypothetical protein  46.47 
 
 		 357 aa  142  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6207  hypothetical protein  44.44 
 
 		 169 aa  143  1e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0430  hypothetical protein  46.47 
 
 		 266 aa  141  4e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.886094  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2271  putative transmembrane protein  44.64 
 
 		 169 aa  140  9e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7364  hypothetical protein  45.03 
 
 		 169 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.412061 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0061  hypothetical protein  46.11 
 
 		 283 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1460  hypothetical protein  28.3 
 
 		 193 aa  73.2  0.000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.116016  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1165  hypothetical protein  28.57 
 
 		 185 aa  69.3  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.712882  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2068  hypothetical protein  30.61 
 
 		 182 aa  51.2  0.000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17980  hypothetical protein  23.21 
 
 		 190 aa  47.4  0.00009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0725  hypothetical protein  22.99 
 
 		 202 aa  45.8  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4251  hypothetical protein  26.83 
 
 		 184 aa  43.9  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49910  hypothetical protein  25.9 
 
 		 227 aa  42.7  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.416187 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04114  hypothetical protein  29.17 
 
 		 72 aa  40.8  0.01  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>