24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_2068 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_2068  hypothetical protein  100 
 
 		 182 aa  372  1e-102  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1460  hypothetical protein  31.03 
 
 		 193 aa  81.6  0.000000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.116016  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5934  hypothetical protein  30.9 
 
 		 169 aa  58.5  0.00000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.476639 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6207  hypothetical protein  30.9 
 
 		 169 aa  58.5  0.00000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1044  hypothetical protein  31.72 
 
 		 357 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6432  hypothetical protein  29.78 
 
 		 169 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.367117  normal  0.177925 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2640  hypothetical protein  30.56 
 
 		 169 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2782  hypothetical protein  30.56 
 
 		 169 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2700  hypothetical protein  26.76 
 
 		 169 aa  55.1  0.0000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2701  hypothetical protein  26.76 
 
 		 169 aa  55.1  0.0000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0430  hypothetical protein  31.03 
 
 		 266 aa  52.8  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.886094  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17980  hypothetical protein  24.39 
 
 		 190 aa  52  0.000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0134  hypothetical protein  29.86 
 
 		 169 aa  51.2  0.000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0159  hypothetical protein  29.86 
 
 		 169 aa  51.2  0.000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1303  hypothetical protein  29.86 
 
 		 169 aa  51.2  0.000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0214  hypothetical protein  30.61 
 
 		 170 aa  51.2  0.000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000429039 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7364  hypothetical protein  31.11 
 
 		 169 aa  50.4  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.412061 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1165  hypothetical protein  26.67 
 
 		 185 aa  49.7  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.712882  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0195  putative transmembrane protein  30.61 
 
 		 170 aa  50.1  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.386415  normal  0.4903 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2777  hypothetical protein  29.93 
 
 		 168 aa  49.3  0.00003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2271  putative transmembrane protein  26.39 
 
 		 169 aa  47.4  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49910  hypothetical protein  30 
 
 		 227 aa  45.4  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.416187 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0724  putative transmembrane protein  24.14 
 
 		 171 aa  44.7  0.0008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.618067  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5131  putative transmembrane protein  24.49 
 
 		 171 aa  44.3  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>