44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_C0140 on replicon NC_007412
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007412  Ava_C0140  hypothetical protein  100 
 
 
257 aa  515  1.0000000000000001e-145  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2867  hypothetical protein  56.68 
 
 
255 aa  273  3e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0942  hypothetical protein  57.49 
 
 
255 aa  271  5.000000000000001e-72  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.410236  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1077  hypothetical protein  52.63 
 
 
255 aa  260  1e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.41011 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1054  putative permease  33.33 
 
 
201 aa  79.7  0.00000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0202  hypothetical protein  29.7 
 
 
172 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4936  signal transduction histidine kinase (STHK), LytS  27.78 
 
 
190 aa  73.9  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.272462 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2751  hypothetical protein  35.19 
 
 
178 aa  73.2  0.000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3824  hypothetical protein  32.9 
 
 
183 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3235  hypothetical protein  32.73 
 
 
182 aa  68.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0885199 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3569  hypothetical protein  31.93 
 
 
157 aa  67.4  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2568  hypothetical protein  33.53 
 
 
421 aa  66.6  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.605817  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0555  hypothetical protein  30.97 
 
 
183 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.913643 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0262  hypothetical protein  26.4 
 
 
187 aa  62  0.000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3410  hypothetical protein  27.22 
 
 
170 aa  60.5  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2385  hypothetical protein  28.33 
 
 
177 aa  59.7  0.00000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7163  hypothetical protein  33.33 
 
 
216 aa  58.2  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.629328  normal  0.0195848 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0130  hypothetical protein  25.62 
 
 
184 aa  55.5  0.0000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.722331  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5578  hypothetical protein  38.1 
 
 
198 aa  52.8  0.000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1454  hypothetical protein  29.89 
 
 
165 aa  52.4  0.000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.390893  normal  0.1262 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27820  hypothetical protein  35.29 
 
 
257 aa  52  0.000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0128  hypothetical protein  34.23 
 
 
187 aa  51.6  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1115  hypothetical protein  24.42 
 
 
176 aa  50.8  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000737552  normal  0.471201 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2182  hypothetical protein  24.39 
 
 
158 aa  50.8  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.596109  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0145  hypothetical protein  41.49 
 
 
187 aa  50.4  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5256  hypothetical protein  29.68 
 
 
160 aa  48.9  0.00007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.51431 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0665  hypothetical protein  27.5 
 
 
154 aa  48.5  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2700  hypothetical protein  25.41 
 
 
169 aa  47.8  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2701  hypothetical protein  25.41 
 
 
169 aa  47.4  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07990  hypothetical protein  28.99 
 
 
160 aa  47.8  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.744035  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1734  hypothetical protein  28.95 
 
 
192 aa  47  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00313917 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0702  hypothetical protein  33.8 
 
 
295 aa  46.2  0.0005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3958  hypothetical protein  31.55 
 
 
274 aa  45.8  0.0007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.161528 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4049  hypothetical protein  27.67 
 
 
183 aa  44.7  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1749  hypothetical protein  30.77 
 
 
195 aa  45.1  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.304613 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1181  hypothetical protein  35.71 
 
 
184 aa  44.3  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.581092  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0807  hypothetical protein  31.18 
 
 
162 aa  43.5  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00387772 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2912  hypothetical protein  31.73 
 
 
238 aa  43.9  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.532871  normal  0.0809036 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1196  hypothetical protein  30.85 
 
 
170 aa  43.5  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.289574  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0806  hypothetical protein  31.19 
 
 
179 aa  43.1  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4334  hypothetical protein  32.39 
 
 
167 aa  43.5  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5139  signal transduction histidine kinase LytS  25 
 
 
522 aa  43.1  0.004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4485  hypothetical protein  30.39 
 
 
186 aa  42.7  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0190167  normal  0.0355281 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2789  hypothetical protein  29.07 
 
 
300 aa  42.4  0.008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.27085  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>