47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_07990 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011899  Hore_07990  hypothetical protein  100 
 
 
160 aa  314  4e-85  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.744035  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3569  hypothetical protein  49.37 
 
 
157 aa  127  6e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2385  hypothetical protein  39.66 
 
 
177 aa  96.7  1e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1454  hypothetical protein  45.62 
 
 
165 aa  90.9  7e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.390893  normal  0.1262 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0486  hypothetical protein  45.73 
 
 
159 aa  88.2  4e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0280674  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0807  hypothetical protein  46.11 
 
 
162 aa  83.2  0.000000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00387772 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4049  hypothetical protein  34.78 
 
 
183 aa  81.3  0.000000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0128  hypothetical protein  34.78 
 
 
187 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2751  hypothetical protein  33.33 
 
 
178 aa  79  0.00000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3410  hypothetical protein  31.65 
 
 
170 aa  78.6  0.00000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4936  signal transduction histidine kinase (STHK), LytS  30.57 
 
 
190 aa  78.2  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.272462 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2568  hypothetical protein  37.74 
 
 
421 aa  77.8  0.00000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.605817  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0145  hypothetical protein  33.96 
 
 
187 aa  77.4  0.00000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1181  hypothetical protein  33.54 
 
 
184 aa  63.2  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.581092  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0140  hypothetical protein  27.81 
 
 
257 aa  61.6  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0202  hypothetical protein  27.88 
 
 
172 aa  60.8  0.000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3235  hypothetical protein  28.66 
 
 
182 aa  60.8  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0885199 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0262  hypothetical protein  26.95 
 
 
187 aa  60.5  0.00000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1077  hypothetical protein  28.77 
 
 
255 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.41011 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2867  hypothetical protein  24.85 
 
 
255 aa  58.5  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2700  hypothetical protein  31.29 
 
 
169 aa  58.2  0.00000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2701  hypothetical protein  31.29 
 
 
169 aa  58.2  0.00000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0853  signal transduction histidine kinase (STHK), LytS  30.3 
 
 
238 aa  57  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.72349 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2182  hypothetical protein  30.92 
 
 
158 aa  57  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.596109  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2960  hypothetical protein  32.7 
 
 
213 aa  55.8  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2777  hypothetical protein  28.76 
 
 
168 aa  56.6  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0942  hypothetical protein  23.67 
 
 
255 aa  55.1  0.0000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.410236  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0013  hypothetical protein  30.29 
 
 
178 aa  53.9  0.0000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0432449  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1118  hypothetical protein  36.25 
 
 
187 aa  53.5  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  unclonable  0.0000113456 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4299  hypothetical protein  29.34 
 
 
201 aa  52.4  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4780  hypothetical protein  38 
 
 
194 aa  52.8  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.242814  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5156  hypothetical protein  35.22 
 
 
201 aa  52.4  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1054  putative permease  26.04 
 
 
201 aa  51.6  0.000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0872  hypothetical protein  30.25 
 
 
201 aa  51.6  0.000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.579086 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0130  hypothetical protein  27.11 
 
 
184 aa  50.8  0.000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.722331  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0595  Signal transduction histidine kinase (STHK), LytS  33.53 
 
 
425 aa  49.3  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0637  hypothetical protein  35.71 
 
 
568 aa  48.9  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3958  hypothetical protein  31.93 
 
 
274 aa  48.5  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.161528 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5578  hypothetical protein  34.15 
 
 
198 aa  47  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0555  hypothetical protein  32.05 
 
 
183 aa  46.2  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.913643 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3611  hypothetical protein  31.84 
 
 
281 aa  45.8  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5139  signal transduction histidine kinase LytS  34.03 
 
 
522 aa  44.7  0.0005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3824  hypothetical protein  30.77 
 
 
183 aa  44.3  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1115  hypothetical protein  25.93 
 
 
176 aa  43.1  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000737552  normal  0.471201 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4729  hypothetical protein  31.52 
 
 
204 aa  42.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2068  hypothetical protein  26.88 
 
 
176 aa  42  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0134546 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2714  hypothetical protein  30.28 
 
 
206 aa  41.2  0.006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>