16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0013 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_0013  hypothetical protein  100 
 
 
178 aa  346  1e-94  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0432449  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2385  hypothetical protein  48.02 
 
 
177 aa  138  3.9999999999999997e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3569  hypothetical protein  37.29 
 
 
157 aa  85.5  4e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0807  hypothetical protein  38.01 
 
 
162 aa  59.3  0.00000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00387772 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07990  hypothetical protein  32.57 
 
 
160 aa  52.4  0.000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.744035  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4936  signal transduction histidine kinase (STHK), LytS  29.08 
 
 
190 aa  50.8  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.272462 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3410  hypothetical protein  21.91 
 
 
170 aa  50.1  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0486  hypothetical protein  30.64 
 
 
159 aa  47  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0280674  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1181  hypothetical protein  28.74 
 
 
184 aa  46.6  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.581092  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2751  hypothetical protein  30.63 
 
 
178 aa  47  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2867  hypothetical protein  24.59 
 
 
255 aa  46.2  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1454  hypothetical protein  29.94 
 
 
165 aa  46.2  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.390893  normal  0.1262 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0140  hypothetical protein  24.86 
 
 
257 aa  45.8  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1077  hypothetical protein  22.42 
 
 
255 aa  45.1  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.41011 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0942  hypothetical protein  21.02 
 
 
255 aa  42.7  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.410236  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3236  hypothetical protein  25.17 
 
 
163 aa  42.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>