59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_0853 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_0853  signal transduction histidine kinase (STHK), LytS  100 
 
 
238 aa  473  1e-132  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.72349 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3235  hypothetical protein  43.32 
 
 
182 aa  138  6e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0885199 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4936  signal transduction histidine kinase (STHK), LytS  36.65 
 
 
190 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.272462 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5139  signal transduction histidine kinase LytS  43.35 
 
 
522 aa  114  1.0000000000000001e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0130  hypothetical protein  34.41 
 
 
184 aa  112  4.0000000000000004e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.722331  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0595  Signal transduction histidine kinase (STHK), LytS  43.64 
 
 
425 aa  107  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0262  hypothetical protein  32.43 
 
 
187 aa  105  8e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0637  hypothetical protein  46.97 
 
 
568 aa  103  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2751  hypothetical protein  36.88 
 
 
178 aa  87.8  1e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0128  hypothetical protein  39.52 
 
 
187 aa  82  0.000000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4049  hypothetical protein  30.43 
 
 
183 aa  79.7  0.00000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0145  hypothetical protein  38.32 
 
 
187 aa  79  0.00000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3236  hypothetical protein  32.34 
 
 
163 aa  77.4  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3569  hypothetical protein  36.65 
 
 
157 aa  72.8  0.000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1181  hypothetical protein  38.1 
 
 
184 aa  68.9  0.00000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.581092  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2568  hypothetical protein  36.88 
 
 
421 aa  67.8  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.605817  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2867  hypothetical protein  29.21 
 
 
255 aa  66.6  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0942  hypothetical protein  29.81 
 
 
255 aa  64.3  0.000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.410236  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1115  hypothetical protein  27.71 
 
 
176 aa  62  0.000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000737552  normal  0.471201 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0202  hypothetical protein  28.57 
 
 
172 aa  59.3  0.00000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3958  hypothetical protein  42.35 
 
 
274 aa  58.5  0.00000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.161528 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1054  putative permease  33.33 
 
 
201 aa  55.8  0.0000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1077  hypothetical protein  32.3 
 
 
255 aa  56.2  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.41011 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0807  hypothetical protein  39.26 
 
 
162 aa  54.7  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00387772 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3792  hypothetical protein  35.4 
 
 
172 aa  54.3  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0736619 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1118  hypothetical protein  39.29 
 
 
187 aa  54.3  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  unclonable  0.0000113456 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2182  hypothetical protein  28.36 
 
 
158 aa  53.5  0.000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.596109  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0555  hypothetical protein  28.31 
 
 
183 aa  53.5  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.913643 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2385  hypothetical protein  31.61 
 
 
177 aa  53.1  0.000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1071  hypothetical protein  32.99 
 
 
164 aa  52  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.223632 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4729  hypothetical protein  36.41 
 
 
204 aa  52  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1454  hypothetical protein  36.65 
 
 
165 aa  51.6  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.390893  normal  0.1262 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4776  hypothetical protein  28.83 
 
 
169 aa  50.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.349059 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3824  hypothetical protein  28.31 
 
 
183 aa  49.3  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0486  hypothetical protein  35.85 
 
 
159 aa  48.9  0.00008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0280674  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0140  hypothetical protein  27.12 
 
 
257 aa  48.1  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07990  hypothetical protein  33.54 
 
 
160 aa  48.5  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.744035  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5156  hypothetical protein  31.48 
 
 
201 aa  47.8  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4299  hypothetical protein  37.89 
 
 
201 aa  47  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2700  hypothetical protein  25.79 
 
 
169 aa  47  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2701  hypothetical protein  25.79 
 
 
169 aa  47  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0934  hypothetical protein  35.93 
 
 
176 aa  45.4  0.0007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0999  hypothetical protein  35.93 
 
 
176 aa  45.4  0.0007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.326101  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1166  hypothetical protein  39.16 
 
 
176 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5410  hypothetical protein  30.05 
 
 
204 aa  45.1  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.891019 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3410  hypothetical protein  30.93 
 
 
170 aa  44.3  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1661  hypothetical protein  28.92 
 
 
168 aa  43.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.22596  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0430  hypothetical protein  27.33 
 
 
266 aa  43.1  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.886094  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5578  hypothetical protein  39.26 
 
 
198 aa  43.5  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1634  hypothetical protein  28.92 
 
 
168 aa  43.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4263  hypothetical protein  36.31 
 
 
176 aa  43.1  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000926543 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0902  hypothetical protein  39.16 
 
 
176 aa  43.1  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1075  hypothetical protein  35.33 
 
 
176 aa  42.7  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.072319999999999e-49 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0919  hypothetical protein  39.16 
 
 
176 aa  42.7  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0665  hypothetical protein  30.83 
 
 
154 aa  42.4  0.006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5711  hypothetical protein  28.57 
 
 
183 aa  42.4  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.491196  normal 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4780  hypothetical protein  46.84 
 
 
194 aa  42.7  0.006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.242814  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4858  hypothetical protein  26.19 
 
 
169 aa  41.6  0.01  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.897161 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1093  hypothetical protein  35.71 
 
 
176 aa  41.6  0.01  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.583723  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>