14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_1115 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_1115  hypothetical protein  100 
 
 
176 aa  352  1e-96  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000737552  normal  0.471201 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0555  hypothetical protein  36.71 
 
 
183 aa  106  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.913643 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3824  hypothetical protein  36.71 
 
 
183 aa  102  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0202  hypothetical protein  33.33 
 
 
172 aa  100  1e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2182  hypothetical protein  36.69 
 
 
158 aa  85.9  2e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.596109  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0853  signal transduction histidine kinase (STHK), LytS  27.16 
 
 
238 aa  61.2  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.72349 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3235  hypothetical protein  28.93 
 
 
182 aa  55.1  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0885199 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1077  hypothetical protein  25 
 
 
255 aa  54.3  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.41011 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0595  Signal transduction histidine kinase (STHK), LytS  27.98 
 
 
425 aa  50.4  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1054  putative permease  34.38 
 
 
201 aa  50.1  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4936  signal transduction histidine kinase (STHK), LytS  24.67 
 
 
190 aa  48.9  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.272462 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0262  hypothetical protein  26.59 
 
 
187 aa  48.5  0.00005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5139  signal transduction histidine kinase LytS  28.29 
 
 
522 aa  48.1  0.00007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0140  hypothetical protein  22.67 
 
 
257 aa  40.8  0.009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>