25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0555 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0555  hypothetical protein  100 
 
 		 183 aa  365  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.913643 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3824  hypothetical protein  88.46 
 
 		 183 aa  300  8.000000000000001e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0202  hypothetical protein  44.52 
 
 		 172 aa  146  1.0000000000000001e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1115  hypothetical protein  36.71 
 
 		 176 aa  114  6e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000737552  normal  0.471201 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2182  hypothetical protein  32.39 
 
 		 158 aa  107  6e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.596109  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2867  hypothetical protein  28.48 
 
 		 255 aa  72.8  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0942  hypothetical protein  30.07 
 
 		 255 aa  69.7  0.00000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.410236  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0140  hypothetical protein  30.77 
 
 		 257 aa  66.2  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1054  putative permease  31.15 
 
 		 201 aa  65.5  0.0000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1077  hypothetical protein  28.87 
 
 		 255 aa  64.3  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.41011 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3569  hypothetical protein  28.39 
 
 		 157 aa  53.5  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0853  signal transduction histidine kinase (STHK), LytS  28.31 
 
 		 238 aa  52  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.72349 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4936  signal transduction histidine kinase (STHK), LytS  22.6 
 
 		 190 aa  52  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.272462 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2568  hypothetical protein  34.18 
 
 		 421 aa  52  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.605817  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0262  hypothetical protein  24.68 
 
 		 187 aa  48.1  0.00007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3235  hypothetical protein  23.63 
 
 		 182 aa  48.1  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0885199 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4049  hypothetical protein  25.56 
 
 		 183 aa  45.8  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2751  hypothetical protein  30.2 
 
 		 178 aa  46.2  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0637  hypothetical protein  30.32 
 
 		 568 aa  45.1  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0595  Signal transduction histidine kinase (STHK), LytS  29.75 
 
 		 425 aa  43.9  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2385  hypothetical protein  21.31 
 
 		 177 aa  42.7  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1196  hypothetical protein  30.48 
 
 		 170 aa  42.7  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.289574  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0130  hypothetical protein  23.17 
 
 		 184 aa  41.6  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.722331  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5139  signal transduction histidine kinase LytS  30 
 
 		 522 aa  41.6  0.007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00660  hypothetical protein  33.04 
 
 		 175 aa  41.2  0.008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>