35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_1077 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_1077  hypothetical protein  100 
 
 
255 aa  525  1e-148  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.41011 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2867  hypothetical protein  69.57 
 
 
255 aa  353  1e-96  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0942  hypothetical protein  67.59 
 
 
255 aa  345  4e-94  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.410236  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0140  hypothetical protein  52.63 
 
 
257 aa  258  6e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0202  hypothetical protein  28.82 
 
 
172 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1054  putative permease  35.71 
 
 
201 aa  79  0.00000000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3235  hypothetical protein  30.38 
 
 
182 aa  68.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0885199 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3824  hypothetical protein  27.51 
 
 
183 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2751  hypothetical protein  30.12 
 
 
178 aa  67  0.0000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4936  signal transduction histidine kinase (STHK), LytS  26.67 
 
 
190 aa  65.5  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.272462 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0555  hypothetical protein  26.57 
 
 
183 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.913643 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2568  hypothetical protein  31.74 
 
 
421 aa  62  0.000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.605817  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0130  hypothetical protein  30.2 
 
 
184 aa  60.8  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.722331  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0262  hypothetical protein  28.86 
 
 
187 aa  59.7  0.00000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3569  hypothetical protein  26.04 
 
 
157 aa  58.5  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2385  hypothetical protein  24.31 
 
 
177 aa  57.8  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1115  hypothetical protein  25 
 
 
176 aa  56.2  0.0000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000737552  normal  0.471201 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2182  hypothetical protein  27.66 
 
 
158 aa  54.3  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.596109  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0853  signal transduction histidine kinase (STHK), LytS  35.44 
 
 
238 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.72349 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0486  hypothetical protein  30.36 
 
 
159 aa  49.7  0.00005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0280674  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1454  hypothetical protein  29.14 
 
 
165 aa  49.7  0.00005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.390893  normal  0.1262 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0128  hypothetical protein  29.66 
 
 
187 aa  48.9  0.00008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0145  hypothetical protein  29.45 
 
 
187 aa  48.9  0.00008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7163  hypothetical protein  26.55 
 
 
216 aa  47.4  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.629328  normal  0.0195848 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4729  hypothetical protein  38.1 
 
 
204 aa  46.2  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4814  ChaB family protein  31.15 
 
 
81 aa  46.2  0.0005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.442759  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3410  hypothetical protein  22.03 
 
 
170 aa  45.8  0.0007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2211  hypothetical protein  24.16 
 
 
175 aa  45.1  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.451727  normal  0.46248 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27820  hypothetical protein  25.4 
 
 
257 aa  44.7  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2785  ChaB  32.2 
 
 
68 aa  45.1  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.167104  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0872  hypothetical protein  23.24 
 
 
201 aa  43.5  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.579086 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4485  hypothetical protein  22.7 
 
 
186 aa  43.1  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0190167  normal  0.0355281 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4299  hypothetical protein  33.57 
 
 
201 aa  42  0.008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1431  hypothetical protein  27.62 
 
 
186 aa  42  0.01  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.766186  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5139  signal transduction histidine kinase LytS  28.74 
 
 
522 aa  42  0.01  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>