15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_C0130 on replicon NC_007412
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007412  Ava_C0130  hypothetical protein  100 
 
 
184 aa  374  1e-103  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.722331  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0262  hypothetical protein  46.93 
 
 
187 aa  171  6.999999999999999e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3235  hypothetical protein  42.78 
 
 
182 aa  152  4e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0885199 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0853  signal transduction histidine kinase (STHK), LytS  33.87 
 
 
238 aa  94.7  6e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.72349 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4936  signal transduction histidine kinase (STHK), LytS  31.18 
 
 
190 aa  87.8  8e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.272462 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5139  signal transduction histidine kinase LytS  32.97 
 
 
522 aa  86.3  2e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0595  Signal transduction histidine kinase (STHK), LytS  37.85 
 
 
425 aa  78.6  0.00000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0637  hypothetical protein  29.38 
 
 
568 aa  67.4  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0942  hypothetical protein  27.78 
 
 
255 aa  55.8  0.0000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.410236  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2867  hypothetical protein  28.4 
 
 
255 aa  54.3  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1077  hypothetical protein  30.2 
 
 
255 aa  54.3  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.41011 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2568  hypothetical protein  25 
 
 
421 aa  46.2  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.605817  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4049  hypothetical protein  25.44 
 
 
183 aa  43.9  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2385  hypothetical protein  29.41 
 
 
177 aa  42.7  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1181  hypothetical protein  29.87 
 
 
184 aa  42.4  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.581092  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>