61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_0637 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_0637  hypothetical protein  100 
 
 
568 aa  1130    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5139  signal transduction histidine kinase LytS  54.51 
 
 
522 aa  398  1e-109  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0595  Signal transduction histidine kinase (STHK), LytS  61.89 
 
 
425 aa  192  2e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4936  signal transduction histidine kinase (STHK), LytS  45.73 
 
 
190 aa  158  3e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.272462 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0853  signal transduction histidine kinase (STHK), LytS  47.47 
 
 
238 aa  139  8.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.72349 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3235  hypothetical protein  38.33 
 
 
182 aa  124  7e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0885199 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0262  hypothetical protein  38.46 
 
 
187 aa  122  1.9999999999999998e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0130  hypothetical protein  35 
 
 
184 aa  106  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.722331  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2751  hypothetical protein  41.14 
 
 
178 aa  95.9  2e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1181  hypothetical protein  43.11 
 
 
184 aa  81.6  0.00000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.581092  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2867  hypothetical protein  27.7 
 
 
255 aa  80.9  0.00000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0128  hypothetical protein  39.63 
 
 
187 aa  79.7  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0140  hypothetical protein  29.76 
 
 
257 aa  79.7  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0145  hypothetical protein  41.43 
 
 
187 aa  78.6  0.0000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0942  hypothetical protein  27.5 
 
 
255 aa  77.8  0.0000000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.410236  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2385  hypothetical protein  29.19 
 
 
177 aa  77  0.0000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4049  hypothetical protein  32.93 
 
 
183 aa  74.7  0.000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3569  hypothetical protein  33.72 
 
 
157 aa  74.3  0.000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1077  hypothetical protein  29.78 
 
 
255 aa  74.3  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.41011 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2568  hypothetical protein  35.5 
 
 
421 aa  74.3  0.000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.605817  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3236  hypothetical protein  29.45 
 
 
163 aa  72.8  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0555  hypothetical protein  29.68 
 
 
183 aa  71.2  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.913643 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3824  hypothetical protein  30.97 
 
 
183 aa  70.1  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0202  hypothetical protein  29.81 
 
 
172 aa  64.7  0.000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1054  putative permease  35.45 
 
 
201 aa  64.3  0.000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1454  hypothetical protein  36.47 
 
 
165 aa  63.9  0.000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.390893  normal  0.1262 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1144  hypothetical protein  27.05 
 
 
170 aa  62  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1115  hypothetical protein  30.25 
 
 
176 aa  61.6  0.00000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000737552  normal  0.471201 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4299  hypothetical protein  41.14 
 
 
201 aa  60.8  0.00000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4263  hypothetical protein  41.03 
 
 
176 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000926543 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07990  hypothetical protein  37.06 
 
 
160 aa  58.9  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.744035  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0934  hypothetical protein  39.87 
 
 
176 aa  58.9  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0999  hypothetical protein  39.87 
 
 
176 aa  58.9  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.326101  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1075  hypothetical protein  39.1 
 
 
176 aa  56.6  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.072319999999999e-49 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1040  hypothetical protein  39.74 
 
 
176 aa  56.2  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1166  hypothetical protein  38.46 
 
 
176 aa  55.8  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1093  hypothetical protein  38.46 
 
 
176 aa  54.7  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.583723  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2182  hypothetical protein  33.33 
 
 
158 aa  55.1  0.000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.596109  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4729  hypothetical protein  36.45 
 
 
204 aa  53.9  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0910  hypothetical protein  38.46 
 
 
176 aa  53.9  0.000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0902  hypothetical protein  38.46 
 
 
176 aa  53.9  0.000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2068  hypothetical protein  31.37 
 
 
176 aa  53.5  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0134546 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5131  putative transmembrane protein  27.33 
 
 
171 aa  53.1  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0919  hypothetical protein  38.46 
 
 
176 aa  52.8  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4858  hypothetical protein  29.89 
 
 
169 aa  52  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.897161 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3958  hypothetical protein  39.89 
 
 
274 aa  51.2  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.161528 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1118  hypothetical protein  40.85 
 
 
187 aa  51.2  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  unclonable  0.0000113456 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0724  putative transmembrane protein  26.25 
 
 
171 aa  50.4  0.00008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.618067  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1071  hypothetical protein  31.43 
 
 
164 aa  49.3  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.223632 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5156  hypothetical protein  34.76 
 
 
201 aa  49.7  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2700  hypothetical protein  26.54 
 
 
169 aa  48.5  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2701  hypothetical protein  26.54 
 
 
169 aa  48.9  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0665  hypothetical protein  32.03 
 
 
154 aa  48.1  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4624  hypothetical protein  33.5 
 
 
197 aa  47.4  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.506407 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0430  hypothetical protein  27.16 
 
 
266 aa  46.6  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.886094  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4780  hypothetical protein  46.84 
 
 
194 aa  46.6  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.242814  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2777  hypothetical protein  40.24 
 
 
168 aa  46.2  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0486  hypothetical protein  33.73 
 
 
159 aa  45.4  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0280674  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0778  hypothetical protein  33.5 
 
 
198 aa  45.1  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1044  hypothetical protein  36.08 
 
 
357 aa  43.9  0.007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1160  hypothetical protein  37.29 
 
 
267 aa  43.5  0.01  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.582536  normal  0.0483553 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>