60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_0778 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_0778  hypothetical protein  100 
 
 		 198 aa  382  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4624  hypothetical protein  77.55 
 
 		 197 aa  196  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.506407 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4049  hypothetical protein  52.85 
 
 		 183 aa  184  9e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5156  hypothetical protein  68.84 
 
 		 201 aa  182  4.0000000000000006e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4729  hypothetical protein  66.67 
 
 		 204 aa  176  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4780  hypothetical protein  66.49 
 
 		 194 aa  166  2.9999999999999998e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.242814  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3958  hypothetical protein  51.01 
 
 		 274 aa  122  4e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.161528 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4299  hypothetical protein  44.33 
 
 		 201 aa  117  7.999999999999999e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3611  hypothetical protein  51.78 
 
 		 281 aa  117  7.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5578  hypothetical protein  50.82 
 
 		 198 aa  115  3e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4130  hypothetical protein  46.15 
 
 		 238 aa  106  2e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.321426 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0738  hypothetical protein  43.88 
 
 		 240 aa  82  0.000000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2470  hypothetical protein  42.05 
 
 		 193 aa  80.1  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0978713  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2867  hypothetical protein  31.31 
 
 		 255 aa  78.2  0.00000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2751  hypothetical protein  37.06 
 
 		 178 aa  76.6  0.0000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2568  hypothetical protein  41.94 
 
 		 421 aa  76.6  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.605817  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0942  hypothetical protein  30.35 
 
 		 255 aa  73.9  0.000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.410236  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0145  hypothetical protein  42.07 
 
 		 187 aa  72.4  0.000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3569  hypothetical protein  37.01 
 
 		 157 aa  71.6  0.000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0128  hypothetical protein  41.38 
 
 		 187 aa  71.2  0.000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4936  signal transduction histidine kinase (STHK), LytS  32.45 
 
 		 190 aa  70.9  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.272462 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0776  hypothetical protein  39.8 
 
 		 238 aa  70.9  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0833478  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3235  hypothetical protein  30.77 
 
 		 182 aa  70.1  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0885199 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0140  hypothetical protein  33.33 
 
 		 257 aa  70.1  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0817  hypothetical protein  40.72 
 
 		 238 aa  70.1  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.470186 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0853  signal transduction histidine kinase (STHK), LytS  37.84 
 
 		 238 aa  68.2  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.72349 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2385  hypothetical protein  31.84 
 
 		 177 aa  67.8  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0262  hypothetical protein  29.38 
 
 		 187 aa  66.6  0.0000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4613  hypothetical protein  36.36 
 
 		 185 aa  65.1  0.0000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0202  hypothetical protein  30.26 
 
 		 172 aa  62  0.000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1181  hypothetical protein  39.73 
 
 		 184 aa  60.5  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.581092  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1077  hypothetical protein  30.82 
 
 		 255 aa  57.4  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.41011 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3236  hypothetical protein  30.43 
 
 		 163 aa  57.4  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0807  hypothetical protein  34.55 
 
 		 162 aa  57.4  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00387772 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3817  hypothetical protein  25.58 
 
 		 294 aa  55.1  0.0000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.719073  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0215  hypothetical protein  25.58 
 
 		 294 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0172  hypothetical protein  24.21 
 
 		 561 aa  53.9  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0383324  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3824  hypothetical protein  32.03 
 
 		 183 aa  52.8  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2182  hypothetical protein  25.19 
 
 		 158 aa  51.6  0.000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.596109  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07990  hypothetical protein  34.38 
 
 		 160 aa  50.8  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.744035  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1454  hypothetical protein  31.45 
 
 		 165 aa  51.2  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.390893  normal  0.1262 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0555  hypothetical protein  30.72 
 
 		 183 aa  50.8  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.913643 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5139  signal transduction histidine kinase LytS  39.26 
 
 		 522 aa  50.4  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0486  hypothetical protein  35.62 
 
 		 159 aa  48.1  0.00008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0280674  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4579  hypothetical protein  29.08 
 
 		 292 aa  48.1  0.00009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.324475 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1118  hypothetical protein  41.03 
 
 		 187 aa  47.8  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000113456 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1869  hypothetical protein  36.76 
 
 		 301 aa  46.6  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0595  Signal transduction histidine kinase (STHK), LytS  41.82 
 
 		 425 aa  46.6  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3629  hypothetical protein  36.76 
 
 		 305 aa  46.2  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00700823 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1054  putative permease  30.77 
 
 		 201 aa  45.4  0.0005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0637  hypothetical protein  33.33 
 
 		 568 aa  45.1  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4072  hypothetical protein  36.71 
 
 		 254 aa  44.7  0.0008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6432  hypothetical protein  29.75 
 
 		 169 aa  43.5  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.367117  normal  0.177925 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0214  hypothetical protein  27.92 
 
 		 170 aa  43.5  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000429039 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2068  hypothetical protein  31.25 
 
 		 176 aa  43.1  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0134546 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1290  hypothetical protein  27.38 
 
 		 163 aa  43.1  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000841188  hitchhiker  0.00412326 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1115  hypothetical protein  23.12 
 
 		 176 aa  42.4  0.004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000737552  normal  0.471201 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0195  putative transmembrane protein  26.92 
 
 		 170 aa  41.6  0.007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.386415  normal  0.4903 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0872  hypothetical protein  27.37 
 
 		 201 aa  41.6  0.007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.579086 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5073  hypothetical protein  27.55 
 
 		 197 aa  41.6  0.008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.191555  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>