44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_1869 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_1869  hypothetical protein  100 
 
 		 301 aa  583  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3629  hypothetical protein  86.94 
 
 		 305 aa  443  1e-123  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00700823 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3817  hypothetical protein  61.17 
 
 		 294 aa  332  4e-90  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.719073  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0215  hypothetical protein  61.17 
 
 		 294 aa  331  9e-90  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0172  hypothetical protein  37.35 
 
 		 561 aa  193  4e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0383324  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2857  hypothetical protein  37.5 
 
 		 312 aa  147  2.0000000000000003e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.128156  normal  0.202978 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4579  hypothetical protein  36.63 
 
 		 292 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.324475 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4072  hypothetical protein  39.06 
 
 		 254 aa  84.7  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1797  hypothetical protein  41.89 
 
 		 219 aa  81.3  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.71846  normal  0.0272572 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1986  hypothetical protein  42.5 
 
 		 225 aa  76.6  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0312653  hitchhiker  0.00472335 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2719  hypothetical protein  40.88 
 
 		 407 aa  72.8  0.000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2534  hypothetical protein  37.02 
 
 		 495 aa  70.5  0.00000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.715554  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7614  hypothetical protein  40.82 
 
 		 395 aa  70.5  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3210  hypothetical protein  36.22 
 
 		 183 aa  70.9  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.743942 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4690  Domain of unknown function DUF2382-like protein  36.42 
 
 		 301 aa  65.1  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1547  hypothetical protein  30.96 
 
 		 246 aa  64.3  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.201538 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3958  hypothetical protein  27.53 
 
 		 274 aa  62.4  0.000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.161528 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3611  hypothetical protein  43.75 
 
 		 281 aa  62  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07780  hypothetical protein  38.26 
 
 		 283 aa  61.6  0.00000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.374906 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03600  conserved domain protein, TIGR02271+C111  40 
 
 		 380 aa  60.5  0.00000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.67855 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0277  hypothetical protein  34.38 
 
 		 282 aa  59.3  0.00000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0810236  normal  0.139993 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3189  hypothetical protein  34.97 
 
 		 233 aa  56.6  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3305  hypothetical protein  35.42 
 
 		 234 aa  56.6  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.194588  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2012  PRC-barrel domain-containing protein  34.68 
 
 		 282 aa  56.2  0.0000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.621139  normal  0.571719 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0251  hypothetical protein  32.03 
 
 		 284 aa  55.5  0.000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.507454  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4955  Domain of unknown function DUF2382-like protein  33.54 
 
 		 366 aa  54.3  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.987311  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5578  hypothetical protein  50 
 
 		 198 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0817  hypothetical protein  50 
 
 		 238 aa  53.1  0.000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.470186 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0776  hypothetical protein  50 
 
 		 238 aa  52.8  0.000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0833478  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0738  hypothetical protein  46.3 
 
 		 240 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1466  Domain of unknown function DUF2382  35.96 
 
 		 291 aa  50.8  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0432048  normal  0.448786 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3180  hypothetical protein  25.2 
 
 		 304 aa  49.7  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3628  hypothetical protein  38.38 
 
 		 176 aa  49.7  0.00006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.146456  hitchhiker  0.00571731 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3384  hypothetical protein  35.29 
 
 		 233 aa  48.5  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1991  PRC-barrel domain protein  29.5 
 
 		 300 aa  47.4  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23200  hypothetical protein  33.1 
 
 		 273 aa  47  0.0004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.738381  normal  0.721654 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1868  hypothetical protein  35.71 
 
 		 152 aa  46.6  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4130  hypothetical protein  39.71 
 
 		 238 aa  45.8  0.0009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.321426 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0214  hypothetical protein  36 
 
 		 163 aa  44.3  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3816  hypothetical protein  36 
 
 		 163 aa  43.9  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.473605  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0778  hypothetical protein  35.59 
 
 		 198 aa  43.5  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0823  PRC-barrel domain protein  30.5 
 
 		 307 aa  42.7  0.007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3466  PRC-barrel domain protein  44.64 
 
 		 299 aa  42.4  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.287037  hitchhiker  0.00773613 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2910  PRC-barrel domain protein  46.43 
 
 		 287 aa  42.4  0.01  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000669631  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>