24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_2534 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_2534  hypothetical protein  100 
 
 		 495 aa  984    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.715554  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2719  hypothetical protein  78.12 
 
 		 407 aa  587  1e-166  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7614  hypothetical protein  70.26 
 
 		 395 aa  513  1e-144  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3837  hypothetical protein  63.68 
 
 		 445 aa  233  6e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0111576  normal  0.104463 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1869  hypothetical protein  42.65 
 
 		 301 aa  75.5  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2857  hypothetical protein  42.15 
 
 		 312 aa  74.7  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.128156  normal  0.202978 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4579  hypothetical protein  37.79 
 
 		 292 aa  72  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.324475 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3817  hypothetical protein  43.44 
 
 		 294 aa  72  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.719073  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0215  hypothetical protein  43.44 
 
 		 294 aa  72  0.00000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3629  hypothetical protein  45.3 
 
 		 305 aa  71.2  0.00000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00700823 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0172  hypothetical protein  35.42 
 
 		 561 aa  70.1  0.0000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0383324  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1182  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  25.68 
 
 		 148 aa  60.8  0.00000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.900555  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2304  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  29.93 
 
 		 155 aa  54.7  0.000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.49085  hitchhiker  0.00000533583 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00300  hemerythrin HHE cation binding protein  32.2 
 
 		 157 aa  53.9  0.000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4394  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  28.26 
 
 		 147 aa  50.8  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.001025  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2008  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  31.63 
 
 		 202 aa  50.8  0.00006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6904  hypothetical protein  29.1 
 
 		 262 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2404  hemerythrin HHE cation binding region  28.28 
 
 		 158 aa  48.5  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00792518 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2426  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  31.58 
 
 		 163 aa  48.5  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.13977  normal  0.0393648 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3032  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  29.81 
 
 		 154 aa  47.4  0.0006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2860  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  31.68 
 
 		 154 aa  46.2  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.184327  normal  0.243367 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3007  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  33.33 
 
 		 154 aa  44.7  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.442011  normal  0.933539 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01683  hypothetical protein  30.08 
 
 		 151 aa  45.1  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0790342  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4690  Domain of unknown function DUF2382-like protein  29.68 
 
 		 301 aa  43.9  0.007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>