55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_2008 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_2008  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  100 
 
 		 202 aa  410  1e-114  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1314  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  57.98 
 
 		 190 aa  219  3e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4773  hypothetical protein  49.46 
 
 		 190 aa  167  1e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0733  hypothetical protein  32.65 
 
 		 195 aa  80.1  0.00000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.21283  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1421  hemerythrin HHE cation binding region protein  34.44 
 
 		 178 aa  78.2  0.00000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4867  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  34.33 
 
 		 158 aa  76.3  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00231267  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2007  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  32.54 
 
 		 164 aa  71.2  0.000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5414  hypothetical protein  35.21 
 
 		 157 aa  70.1  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2248  hypothetical protein  32.79 
 
 		 161 aa  69.7  0.00000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1486  hemerythrin HHE cation binding region  35.51 
 
 		 168 aa  69.3  0.00000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0180  hemerythrin HHE cation binding region protein  35.4 
 
 		 166 aa  67  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4302  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  32 
 
 		 171 aa  66.6  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3822  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  33.1 
 
 		 482 aa  65.9  0.0000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.690759  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2678  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  31.16 
 
 		 187 aa  65.1  0.0000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.027018 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0603  hemerythrin HHE cation binding region  31.85 
 
 		 154 aa  62.4  0.000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.499729  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3879  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  29.32 
 
 		 165 aa  61.6  0.000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4232  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  31.29 
 
 		 178 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4614  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  30.72 
 
 		 185 aa  58.2  0.00000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.178279  normal  0.138326 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0077  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  31.3 
 
 		 158 aa  57.8  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.556159 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0069  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  31.3 
 
 		 158 aa  57.4  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3897  hemerythrin HHE cation binding region  28.67 
 
 		 351 aa  57  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.65028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2480  hypothetical protein  30.28 
 
 		 177 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0435976  normal  0.540036 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3504  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  27.52 
 
 		 271 aa  55.5  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.033907  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2146  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  28.21 
 
 		 350 aa  55.1  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.460261 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1868  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  26.12 
 
 		 144 aa  53.1  0.000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5327  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  25.71 
 
 		 347 aa  52.8  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2793  Hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  30.07 
 
 		 185 aa  52.8  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0769418  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2776  Hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  35.34 
 
 		 184 aa  52  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.1725  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5558  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  27.74 
 
 		 188 aa  52  0.000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.418641 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2534  hypothetical protein  31.63 
 
 		 495 aa  50.8  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.715554  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2453  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  32.86 
 
 		 165 aa  49.7  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.217194  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7183  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  29.05 
 
 		 190 aa  49.7  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2549  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  32.86 
 
 		 165 aa  49.3  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2548  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  31.53 
 
 		 190 aa  48.5  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0858  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  23.01 
 
 		 186 aa  48.5  0.00007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4535  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  26.43 
 
 		 179 aa  47.8  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.739296  normal  0.620598 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0324  hypothetical cytosolic protein  24.63 
 
 		 144 aa  47.8  0.0001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4679  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  30.95 
 
 		 235 aa  47.4  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2831  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  35.71 
 
 		 184 aa  47.4  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2426  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  33.33 
 
 		 163 aa  47.4  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.13977  normal  0.0393648 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5496  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  29.32 
 
 		 184 aa  47  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA02980  conserved hypothetical protein  23.53 
 
 		 220 aa  46.2  0.0003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.959027  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2719  hypothetical protein  28.57 
 
 		 407 aa  45.1  0.0007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2404  hemerythrin HHE cation binding region  30.22 
 
 		 158 aa  45.1  0.0008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00792518 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00300  hemerythrin HHE cation binding protein  34.19 
 
 		 157 aa  45.1  0.0008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08638  HHE domain protein (AFU_orthologue; AFUA_4G00730)  24.79 
 
 		 228 aa  44.3  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000349477  normal  0.759451 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4394  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  25.17 
 
 		 147 aa  43.5  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.001025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1764  hypothetical protein  29.63 
 
 		 150 aa  43.1  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4534  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  20.54 
 
 		 345 aa  42.4  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0146  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  26.61 
 
 		 171 aa  42.7  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.613584  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0129  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  24.66 
 
 		 171 aa  42.4  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1807  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  29.21 
 
 		 194 aa  42.4  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0985875  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4228  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  25.22 
 
 		 233 aa  42.4  0.005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1404  hemerythrin HHE cation binding protein  31.65 
 
 		 165 aa  41.6  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2304  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  30.71 
 
 		 155 aa  41.2  0.01  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.49085  hitchhiker  0.00000533583 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>