80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5414 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_5414  hypothetical protein  100 
 
 
157 aa  313  7e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4867  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  69.23 
 
 
158 aa  226  6e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00231267  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3504  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  38.51 
 
 
271 aa  107  5e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.033907  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2549  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  48.57 
 
 
165 aa  103  9e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2453  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  48.57 
 
 
165 aa  103  1e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.217194  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2480  hypothetical protein  42.58 
 
 
177 aa  97.1  9e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0435976  normal  0.540036 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0069  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  42.18 
 
 
158 aa  95.9  2e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0603  hemerythrin HHE cation binding region  43.36 
 
 
154 aa  95.9  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.499729  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4614  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  39.87 
 
 
185 aa  95.9  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.178279  normal  0.138326 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3879  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  44.53 
 
 
165 aa  95.5  3e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0077  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  41.5 
 
 
158 aa  95.1  3e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.556159 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2007  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  43.51 
 
 
164 aa  94.7  4e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2248  hypothetical protein  44 
 
 
161 aa  94.4  6e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4232  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  42.76 
 
 
178 aa  94  7e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1404  hemerythrin HHE cation binding protein  48.57 
 
 
165 aa  93.2  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0733  hypothetical protein  41.32 
 
 
195 aa  92.4  2e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.21283  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1486  hemerythrin HHE cation binding region  45.14 
 
 
168 aa  92.4  2e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2548  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  35.17 
 
 
190 aa  92  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4302  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  43.24 
 
 
171 aa  91.7  4e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0180  hemerythrin HHE cation binding region protein  39.24 
 
 
166 aa  86.7  1e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2678  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  35.1 
 
 
187 aa  87  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.027018 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7183  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  36.18 
 
 
190 aa  85.9  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2304  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  38.19 
 
 
155 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.49085  hitchhiker  0.00000533583 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2404  hemerythrin HHE cation binding region  38.62 
 
 
158 aa  84.3  5e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00792518 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2776  Hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  36.3 
 
 
184 aa  83.2  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.1725  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5496  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  37.8 
 
 
184 aa  80.5  0.000000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00300  hemerythrin HHE cation binding protein  37.9 
 
 
157 aa  80.5  0.000000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2426  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  45.71 
 
 
163 aa  80.1  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.13977  normal  0.0393648 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1421  hemerythrin HHE cation binding region protein  39.44 
 
 
178 aa  77.8  0.00000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1314  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  37.06 
 
 
190 aa  77.4  0.00000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1807  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  32.89 
 
 
194 aa  76.3  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0985875  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0146  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  34.29 
 
 
171 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.613584  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5558  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  34.33 
 
 
188 aa  75.9  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.418641 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0129  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  31.72 
 
 
171 aa  73.6  0.0000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3822  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  40.87 
 
 
482 aa  73.9  0.0000000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.690759  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2008  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  35.21 
 
 
202 aa  73.6  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4535  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  32.24 
 
 
179 aa  72.8  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.739296  normal  0.620598 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2722  hemerythrin HHE cation binding domain protein  39.01 
 
 
154 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4773  hypothetical protein  33.97 
 
 
190 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2793  Hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  31.08 
 
 
185 aa  70.1  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0769418  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3007  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  39.01 
 
 
154 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.442011  normal  0.933539 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2860  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  37.59 
 
 
154 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.184327  normal  0.243367 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3032  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  37.59 
 
 
154 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3133  hypothetical protein  39.44 
 
 
156 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.682098  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1791  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  30.14 
 
 
346 aa  67.8  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.482606  normal  0.753058 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36520  hypothetical protein  38.26 
 
 
156 aa  67.4  0.00000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00150219  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3326  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  31.34 
 
 
207 aa  67.4  0.00000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4679  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  27.4 
 
 
235 aa  62  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0858  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  35.67 
 
 
186 aa  61.6  0.000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4394  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  30.56 
 
 
147 aa  61.2  0.000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.001025  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1827  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  33.79 
 
 
149 aa  60.8  0.000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4228  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  26.95 
 
 
233 aa  59.3  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1182  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  28.47 
 
 
148 aa  57.8  0.00000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.900555  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3800  Hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  25.68 
 
 
187 aa  57.4  0.00000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000606803 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4534  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  25.18 
 
 
345 aa  57  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1926  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  30.92 
 
 
188 aa  54.7  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.669043  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1992  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  30.92 
 
 
188 aa  54.7  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.709277 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1946  hemerythrin HHE cation binding region  30.92 
 
 
188 aa  54.7  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08638  HHE domain protein (AFU_orthologue; AFUA_4G00730)  25.85 
 
 
228 aa  54.3  0.0000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000349477  normal  0.759451 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2146  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  30.94 
 
 
350 aa  54.3  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.460261 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1868  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  30.28 
 
 
144 aa  53.5  0.000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5327  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  29.84 
 
 
347 aa  52  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3897  hemerythrin HHE cation binding region  26.24 
 
 
351 aa  51.2  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.65028  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1828  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  31.06 
 
 
145 aa  50.4  0.000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2188  hemerythrin HHE cation binding region  30.6 
 
 
162 aa  49.3  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4750  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  30.46 
 
 
190 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.777475  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0324  hypothetical cytosolic protein  28.87 
 
 
144 aa  48.1  0.00005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2070  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  29.27 
 
 
185 aa  47.8  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000612385  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1490  hemerythrin hhE cation-binding domain-containing protein  25.35 
 
 
351 aa  47.8  0.00006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3999  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  29.49 
 
 
202 aa  45.4  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2543  hypothetical protein  29.69 
 
 
216 aa  45.1  0.0004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.771916  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4228  hemerythrin HHE cation binding region  27.33 
 
 
196 aa  45.1  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0691  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  32.29 
 
 
147 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA02980  conserved hypothetical protein  27.08 
 
 
220 aa  44.7  0.0005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.959027  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01683  hypothetical protein  30.43 
 
 
151 aa  43.1  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0790342  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4096  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  28.81 
 
 
183 aa  43.9  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.100934  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2501  hemerythrin  28.21 
 
 
160 aa  41.6  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2831  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  30.38 
 
 
184 aa  41.2  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001938  hypothetical protein  25.4 
 
 
143 aa  40.8  0.007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0340  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  26.4 
 
 
159 aa  40.4  0.009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000991487  hitchhiker  0.00000000430115 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>