70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1807 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_1807  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  100 
 
 
194 aa  386  1e-106  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0985875  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2678  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  43.01 
 
 
187 aa  140  8e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.027018 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2776  Hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  41.85 
 
 
184 aa  120  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.1725  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7183  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  37.95 
 
 
190 aa  116  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2548  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  40.21 
 
 
190 aa  110  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3800  Hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  35.83 
 
 
187 aa  101  7e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000606803 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4228  hemerythrin HHE cation binding region  34.59 
 
 
196 aa  96.7  2e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3999  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  34.27 
 
 
202 aa  94.7  8e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08638  HHE domain protein (AFU_orthologue; AFUA_4G00730)  28.34 
 
 
228 aa  94  1e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000349477  normal  0.759451 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2793  Hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  37.31 
 
 
185 aa  86.7  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0769418  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4867  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  32.69 
 
 
158 aa  82  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00231267  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA02980  conserved hypothetical protein  29.94 
 
 
220 aa  82  0.000000000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.959027  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3504  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  30.21 
 
 
271 aa  80.1  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.033907  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2142  hemerythrin HHE cation binding region  32.2 
 
 
197 aa  73.2  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3326  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  34.27 
 
 
207 aa  73.2  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4750  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  31.25 
 
 
190 aa  73.2  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.777475  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5414  hypothetical protein  32.89 
 
 
157 aa  71.2  0.000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1992  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  31.75 
 
 
188 aa  71.2  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.709277 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1946  hemerythrin HHE cation binding region  31.75 
 
 
188 aa  71.2  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3879  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  31.88 
 
 
165 aa  70.1  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1926  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  31.75 
 
 
188 aa  70.1  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.669043  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5558  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  34.06 
 
 
188 aa  68.9  0.00000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.418641 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4302  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  33.07 
 
 
171 aa  68.6  0.00000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4535  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  29.03 
 
 
179 aa  68.9  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.739296  normal  0.620598 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2248  hypothetical protein  33.08 
 
 
161 aa  68.6  0.00000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2007  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  32.28 
 
 
164 aa  65.1  0.0000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4614  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  28.36 
 
 
185 aa  62  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.178279  normal  0.138326 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0180  hemerythrin HHE cation binding region protein  31.11 
 
 
166 aa  61.2  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3897  hemerythrin HHE cation binding region  26.63 
 
 
351 aa  60.1  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.65028  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1675  hemerythrin hhE cation binding domain-containing protein  30.27 
 
 
193 aa  60.1  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.974431  normal  0.386222 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1490  hemerythrin hhE cation-binding domain-containing protein  27.92 
 
 
351 aa  59.7  0.00000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4228  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  28 
 
 
233 aa  59.3  0.00000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2168  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  34.78 
 
 
188 aa  58.5  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4679  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  28.49 
 
 
235 aa  58.9  0.00000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1421  hemerythrin HHE cation binding region protein  32.17 
 
 
178 aa  58.5  0.00000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4534  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  24.53 
 
 
345 aa  57.8  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05325  conserved hypothetical protein  27.33 
 
 
206 aa  57.8  0.0000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4195  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  33.57 
 
 
188 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1791  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  28.08 
 
 
346 aa  55.5  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.482606  normal  0.753058 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2831  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  32.93 
 
 
184 aa  55.5  0.0000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5327  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  28.85 
 
 
347 aa  55.1  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2070  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  31.02 
 
 
185 aa  55.1  0.0000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000612385  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1887  hemerythrin HHE cation binding region  30.98 
 
 
193 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.182349  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1933  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  30.98 
 
 
193 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1867  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  30.98 
 
 
193 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0876152 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4394  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  27.97 
 
 
147 aa  53.1  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.001025  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0069  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  30.23 
 
 
158 aa  52  0.000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2146  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  26.22 
 
 
350 aa  50.1  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.460261 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0077  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  29.46 
 
 
158 aa  50.4  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.556159 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5496  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  29.13 
 
 
184 aa  49.7  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0733  hypothetical protein  26.09 
 
 
195 aa  49.7  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.21283  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1486  hemerythrin HHE cation binding region  26.47 
 
 
168 aa  49.7  0.00003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1314  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  24.86 
 
 
190 aa  49.7  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4232  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  29.46 
 
 
178 aa  48.9  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2404  hemerythrin HHE cation binding region  27.7 
 
 
158 aa  48.9  0.00005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00792518 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2480  hypothetical protein  28.47 
 
 
177 aa  48.5  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0435976  normal  0.540036 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4773  hypothetical protein  32.95 
 
 
190 aa  48.5  0.00007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1017  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  30.14 
 
 
167 aa  48.1  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3822  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  27.05 
 
 
482 aa  47.8  0.00009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.690759  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2549  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  31.51 
 
 
165 aa  47  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2543  hypothetical protein  30.85 
 
 
216 aa  45.8  0.0004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.771916  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2453  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  30.82 
 
 
165 aa  45.1  0.0007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.217194  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1182  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  25.93 
 
 
148 aa  44.7  0.0008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.900555  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0340  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  30.43 
 
 
159 aa  44.7  0.0008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000991487  hitchhiker  0.00000000430115 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1404  hemerythrin HHE cation binding protein  28.47 
 
 
165 aa  43.5  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0362  hypothetical protein  27.17 
 
 
162 aa  42.4  0.004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4844  cyclase/dehydrase  29.14 
 
 
328 aa  42.4  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.327815  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2188  hemerythrin HHE cation binding region  27.59 
 
 
162 aa  42  0.005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2008  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  29.21 
 
 
202 aa  41.6  0.007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0691  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  29.76 
 
 
147 aa  41.2  0.009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>