45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_4195 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_4195  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  100 
 
 
188 aa  371  1e-102  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2168  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  84.04 
 
 
188 aa  298  2e-80  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1946  hemerythrin HHE cation binding region  75 
 
 
188 aa  273  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1992  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  75 
 
 
188 aa  273  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.709277 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1926  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  75 
 
 
188 aa  272  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.669043  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4750  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  53.51 
 
 
190 aa  182  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.777475  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1867  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  52.75 
 
 
193 aa  163  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0876152 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1887  hemerythrin HHE cation binding region  52.75 
 
 
193 aa  163  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.182349  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1933  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  52.75 
 
 
193 aa  163  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1675  hemerythrin hhE cation binding domain-containing protein  46.07 
 
 
193 aa  144  7.0000000000000006e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.974431  normal  0.386222 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3999  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  45.14 
 
 
202 aa  127  7.000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4228  hemerythrin HHE cation binding region  44.63 
 
 
196 aa  124  7e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2070  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  48.09 
 
 
185 aa  114  8.999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000612385  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2142  hemerythrin HHE cation binding region  43.35 
 
 
197 aa  94.7  6e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4844  cyclase/dehydrase  39.26 
 
 
328 aa  80.1  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.327815  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2678  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  31.25 
 
 
187 aa  78.6  0.00000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.027018 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7183  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  29.61 
 
 
190 aa  76.3  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6540  cyclase/dehydrase  37.19 
 
 
287 aa  70.1  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.472702  normal  0.0557794 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2776  Hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  28.76 
 
 
184 aa  69.3  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.1725  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1807  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  33.57 
 
 
194 aa  67  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0985875  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0831  hypothetical protein  32.88 
 
 
194 aa  63.9  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.763872 
 
 
-
 
NC_006670  CNA02980  conserved hypothetical protein  26.04 
 
 
220 aa  61.2  0.000000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.959027  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08638  HHE domain protein (AFU_orthologue; AFUA_4G00730)  21.97 
 
 
228 aa  60.8  0.00000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000349477  normal  0.759451 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2146  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  28.48 
 
 
350 aa  58.2  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.460261 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4679  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  27.27 
 
 
235 aa  55.5  0.0000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3897  hemerythrin HHE cation binding region  26.47 
 
 
351 aa  54.7  0.0000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.65028  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5327  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  26.32 
 
 
347 aa  53.9  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3800  Hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  27.43 
 
 
187 aa  53.9  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000606803 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4535  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  25.86 
 
 
179 aa  53.1  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.739296  normal  0.620598 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4867  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  26.67 
 
 
158 aa  50.8  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00231267  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3504  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  26.54 
 
 
271 aa  50.8  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.033907  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1828  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  31.25 
 
 
145 aa  49.7  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1791  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  25.19 
 
 
346 aa  49.7  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.482606  normal  0.753058 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2793  Hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  26.11 
 
 
185 aa  49.3  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0769418  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4228  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  26.97 
 
 
233 aa  48.9  0.00004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4534  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  29.27 
 
 
345 aa  48.9  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5558  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  33.62 
 
 
188 aa  47.4  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.418641 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0069  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  31.2 
 
 
158 aa  46.6  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0077  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  31.2 
 
 
158 aa  46.6  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.556159 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2548  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  29.94 
 
 
190 aa  45.4  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05325  conserved hypothetical protein  23.66 
 
 
206 aa  45.1  0.0006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2501  hemerythrin  27.74 
 
 
160 aa  43.9  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0340  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  26.17 
 
 
159 aa  43.1  0.003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000991487  hitchhiker  0.00000000430115 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1490  hemerythrin hhE cation-binding domain-containing protein  22.06 
 
 
351 aa  42.7  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1868  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  26.43 
 
 
144 aa  42.4  0.004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>