44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4679 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_4679  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  100 
 
 		 235 aa  451  1.0000000000000001e-126  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4228  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  47.94 
 
 		 233 aa  163  2.0000000000000002e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2678  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  33.73 
 
 		 187 aa  92  8e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.027018 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7183  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  36.09 
 
 		 190 aa  85.1  8e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3800  Hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  32.74 
 
 		 187 aa  80.1  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000606803 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2776  Hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  28.14 
 
 		 184 aa  75.1  0.0000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.1725  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1675  hemerythrin hhE cation binding domain-containing protein  29.84 
 
 		 193 aa  74.3  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.974431  normal  0.386222 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08638  HHE domain protein (AFU_orthologue; AFUA_4G00730)  23.81 
 
 		 228 aa  71.6  0.000000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000349477  normal  0.759451 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3504  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  34.08 
 
 		 271 aa  69.7  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.033907  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2793  Hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  33.85 
 
 		 185 aa  65.9  0.0000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0769418  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA02980  conserved hypothetical protein  24.23 
 
 		 220 aa  64.7  0.000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.959027  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4750  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  29.03 
 
 		 190 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.777475  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1926  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  29.21 
 
 		 188 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.669043  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2548  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  34.09 
 
 		 190 aa  63.2  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1946  hemerythrin HHE cation binding region  28.65 
 
 		 188 aa  63.2  0.000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1992  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  28.65 
 
 		 188 aa  63.2  0.000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.709277 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3999  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  27.91 
 
 		 202 aa  62.4  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2168  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  30.72 
 
 		 188 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1807  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  28.49 
 
 		 194 aa  58.9  0.00000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0985875  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2070  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  30.23 
 
 		 185 aa  58.5  0.00000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000612385  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4535  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  29.75 
 
 		 179 aa  58.5  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.739296  normal  0.620598 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5414  hypothetical protein  27.4 
 
 		 157 aa  57.4  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4867  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  27.33 
 
 		 158 aa  56.2  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00231267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4195  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  27.27 
 
 		 188 aa  53.5  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1867  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  31.48 
 
 		 193 aa  52.4  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0876152 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1887  hemerythrin HHE cation binding region  31.48 
 
 		 193 aa  52.4  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.182349  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1933  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  31.48 
 
 		 193 aa  52.4  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2142  hemerythrin HHE cation binding region  27.78 
 
 		 197 aa  52  0.000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4228  hemerythrin HHE cation binding region  24.42 
 
 		 196 aa  50.8  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3326  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  36.67 
 
 		 207 aa  50.1  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4773  hypothetical protein  29.37 
 
 		 190 aa  50.1  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05325  conserved hypothetical protein  23.12 
 
 		 206 aa  49.3  0.00005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2008  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  30.95 
 
 		 202 aa  47  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1182  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  26.72 
 
 		 148 aa  47.4  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.900555  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0499  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  29.46 
 
 		 222 aa  46.2  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3897  hemerythrin HHE cation binding region  23.23 
 
 		 351 aa  45.1  0.0009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.65028  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2549  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  26.72 
 
 		 165 aa  43.9  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4394  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  26.28 
 
 		 147 aa  44.3  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.001025  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2453  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  26.72 
 
 		 165 aa  43.5  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.217194  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4232  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  31.91 
 
 		 178 aa  42.7  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1490  hemerythrin hhE cation-binding domain-containing protein  24.16 
 
 		 351 aa  42.7  0.005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0736  hypothetical protein  30.11 
 
 		 213 aa  42.4  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.388253  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0733  hypothetical protein  26.92 
 
 		 195 aa  42.4  0.006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.21283  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2480  hypothetical protein  32.26 
 
 		 177 aa  42  0.008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0435976  normal  0.540036 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>