47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1675 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_1675  hemerythrin hhE cation binding domain-containing protein  100 
 
 
193 aa  380  1e-105  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.974431  normal  0.386222 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2070  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  60.34 
 
 
185 aa  169  2e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000612385  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1946  hemerythrin HHE cation binding region  50 
 
 
188 aa  161  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1992  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  50 
 
 
188 aa  161  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.709277 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1926  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  50 
 
 
188 aa  160  1e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.669043  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4750  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  45.45 
 
 
190 aa  148  4e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.777475  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2168  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  48.31 
 
 
188 aa  144  8.000000000000001e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4195  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  46.07 
 
 
188 aa  134  7.000000000000001e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1887  hemerythrin HHE cation binding region  47.46 
 
 
193 aa  130  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.182349  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1933  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  47.46 
 
 
193 aa  130  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1867  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  47.46 
 
 
193 aa  130  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0876152 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0831  hypothetical protein  43.24 
 
 
194 aa  121  7e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.763872 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3999  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  35.96 
 
 
202 aa  107  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4228  hemerythrin HHE cation binding region  35.75 
 
 
196 aa  99.8  3e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4844  cyclase/dehydrase  37.76 
 
 
328 aa  98.2  7e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.327815  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6540  cyclase/dehydrase  36.62 
 
 
287 aa  96.3  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.472702  normal  0.0557794 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2142  hemerythrin HHE cation binding region  38.29 
 
 
197 aa  89.4  3e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7183  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  32.24 
 
 
190 aa  88.2  6e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2776  Hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  29.05 
 
 
184 aa  81.6  0.000000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.1725  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2678  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  30.39 
 
 
187 aa  79.7  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.027018 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4679  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  29.84 
 
 
235 aa  74.3  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2548  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  31.25 
 
 
190 aa  65.9  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA02980  conserved hypothetical protein  26.46 
 
 
220 aa  64.3  0.000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.959027  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3800  Hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  28.25 
 
 
187 aa  62.8  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000606803 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1807  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  30.27 
 
 
194 aa  60.1  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0985875  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3897  hemerythrin HHE cation binding region  27.4 
 
 
351 aa  56.6  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.65028  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08638  HHE domain protein (AFU_orthologue; AFUA_4G00730)  20.69 
 
 
228 aa  52  0.000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000349477  normal  0.759451 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4534  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  25.52 
 
 
345 aa  50.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2793  Hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  25.73 
 
 
185 aa  49.7  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0769418  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4302  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  27.82 
 
 
171 aa  50.1  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1490  hemerythrin hhE cation-binding domain-containing protein  27.1 
 
 
351 aa  50.1  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05325  conserved hypothetical protein  24.75 
 
 
206 aa  49.7  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4535  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  29.71 
 
 
179 aa  48.9  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.739296  normal  0.620598 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5496  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  30.08 
 
 
184 aa  46.2  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3504  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  30.19 
 
 
271 aa  45.1  0.0006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.033907  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2453  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  26.21 
 
 
165 aa  44.7  0.0009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.217194  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2248  hypothetical protein  28.67 
 
 
161 aa  43.9  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2549  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  26.21 
 
 
165 aa  43.9  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0858  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  39.77 
 
 
186 aa  43.9  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1791  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  30.77 
 
 
346 aa  42.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.482606  normal  0.753058 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2146  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  27.61 
 
 
350 aa  42.4  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.460261 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5327  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  24.81 
 
 
347 aa  42.4  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2860  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  33.33 
 
 
154 aa  42.4  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.184327  normal  0.243367 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1827  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  26.88 
 
 
149 aa  42.4  0.004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4096  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  28.79 
 
 
183 aa  42  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.100934  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0069  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  26.06 
 
 
158 aa  41.2  0.009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4614  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  25.19 
 
 
185 aa  41.2  0.009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.178279  normal  0.138326 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>