47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_1992 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_1926  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  99.47 
 
 
188 aa  368  1e-101  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.669043  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1946  hemerythrin HHE cation binding region  100 
 
 
188 aa  369  1e-101  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1992  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  100 
 
 
188 aa  369  1e-101  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.709277 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2168  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  77.66 
 
 
188 aa  270  8.000000000000001e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4195  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  75 
 
 
188 aa  259  1e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4750  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  53.51 
 
 
190 aa  182  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.777475  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1867  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  54.4 
 
 
193 aa  170  1e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0876152 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1887  hemerythrin HHE cation binding region  54.4 
 
 
193 aa  169  2e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.182349  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1933  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  54.4 
 
 
193 aa  169  2e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1675  hemerythrin hhE cation binding domain-containing protein  50 
 
 
193 aa  161  5.0000000000000005e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.974431  normal  0.386222 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4228  hemerythrin HHE cation binding region  46.89 
 
 
196 aa  127  6e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3999  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  43.89 
 
 
202 aa  125  3e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2070  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  49.18 
 
 
185 aa  121  5e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000612385  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2142  hemerythrin HHE cation binding region  45.66 
 
 
197 aa  103  2e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4844  cyclase/dehydrase  42.22 
 
 
328 aa  89.7  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.327815  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2678  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  31.43 
 
 
187 aa  88.2  7e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.027018 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6540  cyclase/dehydrase  41.18 
 
 
287 aa  86.3  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.472702  normal  0.0557794 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7183  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  30.22 
 
 
190 aa  79  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0831  hypothetical protein  35.8 
 
 
194 aa  77.4  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.763872 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2776  Hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  29.21 
 
 
184 aa  73.6  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.1725  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1807  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  31.75 
 
 
194 aa  71.2  0.000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0985875  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08638  HHE domain protein (AFU_orthologue; AFUA_4G00730)  22.67 
 
 
228 aa  67.8  0.00000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000349477  normal  0.759451 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4679  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  28.65 
 
 
235 aa  63.2  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2793  Hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  28.89 
 
 
185 aa  62.4  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0769418  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4535  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  27.01 
 
 
179 aa  62  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.739296  normal  0.620598 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3800  Hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  28.57 
 
 
187 aa  61.6  0.000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000606803 
 
 
-
 
NC_006670  CNA02980  conserved hypothetical protein  23.67 
 
 
220 aa  55.5  0.0000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.959027  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05325  conserved hypothetical protein  24.87 
 
 
206 aa  54.7  0.0000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3504  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  29.27 
 
 
271 aa  54.3  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.033907  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2548  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  29.55 
 
 
190 aa  52.4  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0069  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  34.4 
 
 
158 aa  52  0.000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0077  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  33.6 
 
 
158 aa  50.8  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.556159 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3897  hemerythrin HHE cation binding region  26.81 
 
 
351 aa  50.4  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.65028  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4867  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  25.5 
 
 
158 aa  49.7  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00231267  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2146  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  25.83 
 
 
350 aa  48.5  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.460261 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5414  hypothetical protein  30.92 
 
 
157 aa  48.1  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5558  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  35.65 
 
 
188 aa  45.1  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.418641 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1868  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  25.68 
 
 
144 aa  44.3  0.001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1490  hemerythrin hhE cation-binding domain-containing protein  23.57 
 
 
351 aa  43.1  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4394  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  28.37 
 
 
147 aa  43.1  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.001025  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1182  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  25.58 
 
 
148 aa  42.7  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.900555  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0324  hypothetical cytosolic protein  25.68 
 
 
144 aa  42.7  0.003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1791  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  26.47 
 
 
346 aa  42.4  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.482606  normal  0.753058 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5496  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  28.37 
 
 
184 aa  42  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0858  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  31.43 
 
 
186 aa  42  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5327  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  24.34 
 
 
347 aa  41.6  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0691  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  29.2 
 
 
147 aa  41.6  0.007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>