82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2678 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_2678  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  100 
 
 
187 aa  372  1e-102  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.027018 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2776  Hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  62.78 
 
 
184 aa  205  4e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.1725  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2793  Hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  53.41 
 
 
185 aa  177  5.999999999999999e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0769418  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3800  Hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  47.46 
 
 
187 aa  171  7.999999999999999e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000606803 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7183  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  44.2 
 
 
190 aa  154  7e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2548  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  46.77 
 
 
190 aa  153  1e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1807  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  43.01 
 
 
194 aa  140  7e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0985875  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3504  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  40.64 
 
 
271 aa  115  5e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.033907  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08638  HHE domain protein (AFU_orthologue; AFUA_4G00730)  31.21 
 
 
228 aa  105  4e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000349477  normal  0.759451 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4535  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  33.89 
 
 
179 aa  102  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.739296  normal  0.620598 
 
 
-
 
NC_006670  CNA02980  conserved hypothetical protein  31.32 
 
 
220 aa  94  1e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.959027  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3999  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  33.52 
 
 
202 aa  93.6  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4679  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  33.73 
 
 
235 aa  92  5e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1946  hemerythrin HHE cation binding region  31.43 
 
 
188 aa  88.2  7e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1992  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  31.43 
 
 
188 aa  88.2  7e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.709277 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3326  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  37.68 
 
 
207 aa  87.8  8e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4867  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  36 
 
 
158 aa  87.4  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00231267  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1926  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  31.43 
 
 
188 aa  87.4  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.669043  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4750  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  32 
 
 
190 aa  85.1  6e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.777475  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4228  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  33.33 
 
 
233 aa  85.1  6e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5558  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  37.12 
 
 
188 aa  84.3  9e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.418641 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1675  hemerythrin hhE cation binding domain-containing protein  30.39 
 
 
193 aa  79.7  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.974431  normal  0.386222 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4228  hemerythrin HHE cation binding region  27.96 
 
 
196 aa  79.3  0.00000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5414  hypothetical protein  35.1 
 
 
157 aa  78.6  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1887  hemerythrin HHE cation binding region  32.02 
 
 
193 aa  75.9  0.0000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.182349  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1933  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  32.02 
 
 
193 aa  75.9  0.0000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1867  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  32.02 
 
 
193 aa  75.9  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0876152 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2168  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  32.39 
 
 
188 aa  74.3  0.0000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05325  conserved hypothetical protein  28.81 
 
 
206 aa  72.4  0.000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4232  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  35.66 
 
 
178 aa  71.2  0.000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4195  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  31.25 
 
 
188 aa  70.1  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4614  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  32.37 
 
 
185 aa  67.8  0.00000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.178279  normal  0.138326 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0077  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  31.15 
 
 
158 aa  66.2  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.556159 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2480  hypothetical protein  34.25 
 
 
177 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0435976  normal  0.540036 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2070  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  34.66 
 
 
185 aa  66.6  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000612385  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1314  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  31.91 
 
 
190 aa  65.9  0.0000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4534  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  25.52 
 
 
345 aa  65.1  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0069  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  30.33 
 
 
158 aa  65.1  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2008  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  31.16 
 
 
202 aa  65.1  0.0000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2549  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  30 
 
 
165 aa  63.9  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2453  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  30 
 
 
165 aa  63.5  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.217194  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3879  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  31.01 
 
 
165 aa  62.8  0.000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2142  hemerythrin HHE cation binding region  27.17 
 
 
197 aa  60.8  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5496  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  29.48 
 
 
184 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0733  hypothetical protein  27.56 
 
 
195 aa  60.5  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.21283  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1486  hemerythrin HHE cation binding region  30.34 
 
 
168 aa  60.8  0.00000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2007  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  29.46 
 
 
164 aa  59.3  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3897  hemerythrin HHE cation binding region  26.14 
 
 
351 aa  59.3  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.65028  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4394  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  28.06 
 
 
147 aa  59.7  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.001025  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0831  hypothetical protein  29.45 
 
 
194 aa  58.5  0.00000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.763872 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6540  cyclase/dehydrase  29.51 
 
 
287 aa  58.5  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.472702  normal  0.0557794 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1868  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  26.32 
 
 
144 aa  58.2  0.00000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1404  hemerythrin HHE cation binding protein  31.33 
 
 
165 aa  57  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2248  hypothetical protein  26.36 
 
 
161 aa  57  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4844  cyclase/dehydrase  26.06 
 
 
328 aa  57  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.327815  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5327  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  25.83 
 
 
347 aa  55.8  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4302  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  30.25 
 
 
171 aa  56.2  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2831  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  31.25 
 
 
184 aa  54.7  0.0000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1017  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  29.19 
 
 
167 aa  54.3  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0180  hemerythrin HHE cation binding region protein  27.81 
 
 
166 aa  53.9  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4773  hypothetical protein  29.71 
 
 
190 aa  53.5  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0324  hypothetical cytosolic protein  24.81 
 
 
144 aa  53.1  0.000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3822  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  28.21 
 
 
482 aa  52  0.000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.690759  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0603  hemerythrin HHE cation binding region  28.23 
 
 
154 aa  52  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.499729  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2146  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  25.33 
 
 
350 aa  51.6  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.460261 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1791  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  25.52 
 
 
346 aa  50.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.482606  normal  0.753058 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2543  hypothetical protein  29.29 
 
 
216 aa  49.7  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.771916  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0340  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  27.41 
 
 
159 aa  49.3  0.00003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000991487  hitchhiker  0.00000000430115 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1490  hemerythrin hhE cation-binding domain-containing protein  23.29 
 
 
351 aa  49.3  0.00004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0362  hypothetical protein  26.12 
 
 
162 aa  48.5  0.00006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00300  hemerythrin HHE cation binding protein  29.51 
 
 
157 aa  47.4  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01683  hypothetical protein  29.75 
 
 
151 aa  47  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0790342  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1421  hemerythrin HHE cation binding region protein  28.87 
 
 
178 aa  45.4  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001938  hypothetical protein  28.57 
 
 
143 aa  44.7  0.0009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2426  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  27.74 
 
 
163 aa  43.1  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.13977  normal  0.0393648 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0129  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  23.72 
 
 
171 aa  43.1  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1182  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  23.36 
 
 
148 aa  42.7  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.900555  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1146  hemerythrin HHE cation binding region  29.17 
 
 
146 aa  42  0.005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.184168  normal  0.471523 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3570  hemerythrin HHE cation binding region  30.69 
 
 
145 aa  42  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.499938 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1498  hypothetical protein  27.5 
 
 
231 aa  41.6  0.007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0829172  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0691  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  27.93 
 
 
147 aa  41.6  0.008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1764  hypothetical protein  25.69 
 
 
150 aa  41.2  0.008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>