41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_5327 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_5327  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  100 
 
 
347 aa  714    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2146  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  74.78 
 
 
350 aa  556  1e-157  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.460261 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3897  hemerythrin HHE cation binding region  64.55 
 
 
351 aa  486  1e-136  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.65028  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4534  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  56.4 
 
 
345 aa  439  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1490  hemerythrin hhE cation-binding domain-containing protein  56.65 
 
 
351 aa  433  1e-120  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1791  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  55.49 
 
 
346 aa  405  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.482606  normal  0.753058 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2776  Hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  29.25 
 
 
184 aa  59.7  0.00000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.1725  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1421  hemerythrin HHE cation binding region protein  30.63 
 
 
178 aa  59.3  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1314  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  28.81 
 
 
190 aa  56.6  0.0000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2678  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  25.83 
 
 
187 aa  55.8  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.027018 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1807  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  28.85 
 
 
194 aa  55.1  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0985875  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00300  hemerythrin HHE cation binding protein  29.03 
 
 
157 aa  54.3  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7183  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  28.8 
 
 
190 aa  53.9  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2793  Hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  24.83 
 
 
185 aa  53.1  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0769418  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5558  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  28.15 
 
 
188 aa  52.4  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.418641 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2008  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  26.98 
 
 
202 aa  52  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0733  hypothetical protein  28.93 
 
 
195 aa  52  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.21283  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0691  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  26.81 
 
 
147 aa  52  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0603  hemerythrin HHE cation binding region  31.36 
 
 
154 aa  50.4  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.499729  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2548  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  25.16 
 
 
190 aa  50.1  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4867  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  25.35 
 
 
158 aa  49.7  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00231267  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4302  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  27.73 
 
 
171 aa  47.8  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4195  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  26.32 
 
 
188 aa  47.4  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3800  Hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  27.56 
 
 
187 aa  47.4  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000606803 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5414  hypothetical protein  30 
 
 
157 aa  47  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2404  hemerythrin HHE cation binding region  26.28 
 
 
158 aa  47  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00792518 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08638  HHE domain protein (AFU_orthologue; AFUA_4G00730)  26.28 
 
 
228 aa  46.6  0.0007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000349477  normal  0.759451 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3879  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  29.55 
 
 
165 aa  46.2  0.0009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0129  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  24.32 
 
 
171 aa  45.4  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0180  hemerythrin HHE cation binding region protein  28.46 
 
 
166 aa  45.1  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2549  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  28.67 
 
 
165 aa  45.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2007  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  28.36 
 
 
164 aa  44.7  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4750  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  26.39 
 
 
190 aa  44.3  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.777475  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4302  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  26.97 
 
 
168 aa  44.7  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0069  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  28.07 
 
 
158 aa  43.9  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4773  hypothetical protein  24.81 
 
 
190 aa  43.9  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2453  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  28 
 
 
165 aa  43.1  0.006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.217194  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3999  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  29.1 
 
 
202 aa  43.5  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2773  hypothetical protein  26.09 
 
 
147 aa  43.1  0.007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0249473  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0077  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  28.07 
 
 
158 aa  42.7  0.008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.556159 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0858  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  26.79 
 
 
186 aa  42.7  0.009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>