37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_2773 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2773  hypothetical protein  100 
 
 		 147 aa  296  6e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0249473  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2501  hemerythrin  93.2 
 
 		 160 aa  278  2e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3570  hemerythrin HHE cation binding region  84.83 
 
 		 145 aa  251  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.499938 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0691  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  67.61 
 
 		 147 aa  191  4e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1146  hemerythrin HHE cation binding region  58.9 
 
 		 146 aa  182  9e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.184168  normal  0.471523 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001938  hypothetical protein  57.25 
 
 		 143 aa  164  2.9999999999999998e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4086  hemerythrin HHE cation binding region  57.34 
 
 		 146 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01683  hypothetical protein  54.11 
 
 		 151 aa  156  9e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0790342  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2777  hemerythrin HHE cation binding protein  51.06 
 
 		 145 aa  151  2e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3909  hemerythrin HHE cation binding region  55.1 
 
 		 147 aa  145  2.0000000000000003e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.288591  normal  0.315835 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0340  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  55.32 
 
 		 159 aa  144  3e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000991487  hitchhiker  0.00000000430115 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0362  hypothetical protein  53.19 
 
 		 162 aa  143  9e-34  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3465  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  55.94 
 
 		 147 aa  140  4e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.15554  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0996  hypothetical protein  49.28 
 
 		 169 aa  123  8.000000000000001e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.457689  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2004  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  45.32 
 
 		 151 aa  123  9e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4394  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  35.71 
 
 		 147 aa  88.2  4e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.001025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2188  hemerythrin HHE cation binding region  32.88 
 
 		 162 aa  84.7  4e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1182  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  32.85 
 
 		 148 aa  72.8  0.000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.900555  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0129  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  28.67 
 
 		 171 aa  62.4  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0146  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  27.27 
 
 		 171 aa  58.9  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.613584  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1868  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  30.22 
 
 		 144 aa  47.8  0.00005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0324  hypothetical cytosolic protein  29.5 
 
 		 144 aa  47.8  0.00005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3837  hypothetical protein  25.47 
 
 		 445 aa  47.8  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0111576  normal  0.104463 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4534  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  27.78 
 
 		 345 aa  47.4  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7183  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  28.33 
 
 		 190 aa  45.1  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00300  hemerythrin HHE cation binding protein  32 
 
 		 157 aa  44.3  0.0005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5327  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  26.09 
 
 		 347 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6817  hypothetical protein  26 
 
 		 185 aa  43.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3800  Hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  30.23 
 
 		 187 aa  43.1  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000606803 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2534  hypothetical protein  23.58 
 
 		 495 aa  42.4  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.715554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1827  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  28.47 
 
 		 149 aa  42  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4867  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  28.3 
 
 		 158 aa  42  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00231267  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2793  Hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  24.82 
 
 		 185 aa  41.6  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0769418  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0069  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  32.63 
 
 		 158 aa  41.6  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0077  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  32.63 
 
 		 158 aa  40.8  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.556159 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1828  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  28.57 
 
 		 145 aa  40.8  0.007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1791  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  26.39 
 
 		 346 aa  40.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.482606  normal  0.753058 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>