25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_2777 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_2777  hemerythrin HHE cation binding protein  100 
 
 
145 aa  290  5e-78  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3570  hemerythrin HHE cation binding region  53.57 
 
 
145 aa  157  6e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.499938 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4086  hemerythrin HHE cation binding region  53.9 
 
 
146 aa  155  1e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2501  hemerythrin  51.08 
 
 
160 aa  152  1e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2773  hypothetical protein  51.06 
 
 
147 aa  151  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0249473  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001938  hypothetical protein  51.8 
 
 
143 aa  149  1e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3909  hemerythrin HHE cation binding region  55 
 
 
147 aa  148  2e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.288591  normal  0.315835 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01683  hypothetical protein  50.7 
 
 
151 aa  146  8e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0790342  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0691  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  52.94 
 
 
147 aa  143  9e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3465  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  54.29 
 
 
147 aa  140  6e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.15554  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1146  hemerythrin HHE cation binding region  47.79 
 
 
146 aa  138  3e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.184168  normal  0.471523 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0340  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  44.53 
 
 
159 aa  111  3e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000991487  hitchhiker  0.00000000430115 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2004  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  40.14 
 
 
151 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2188  hemerythrin HHE cation binding region  40.71 
 
 
162 aa  107  4.0000000000000004e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0362  hypothetical protein  40.88 
 
 
162 aa  102  1e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4394  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  40 
 
 
147 aa  102  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.001025  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0996  hypothetical protein  40.85 
 
 
169 aa  97.1  7e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.457689  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1182  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  34.04 
 
 
148 aa  83.6  9e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.900555  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0146  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  29.93 
 
 
171 aa  66.2  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.613584  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0129  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  28.57 
 
 
171 aa  63.2  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1828  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  32.85 
 
 
145 aa  52  0.000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5558  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  31.07 
 
 
188 aa  50.4  0.000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.418641 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1486  hemerythrin HHE cation binding region  28.57 
 
 
168 aa  48.9  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1764  hypothetical protein  26.28 
 
 
150 aa  45.1  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2793  Hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  30.48 
 
 
185 aa  42.4  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0769418  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>