35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2188 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_2188  hemerythrin HHE cation binding region  100 
 
 		 162 aa  319  9.999999999999999e-87  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2777  hemerythrin HHE cation binding protein  40.71 
 
 		 145 aa  107  5e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4086  hemerythrin HHE cation binding region  36.3 
 
 		 146 aa  103  1e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4394  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  40.56 
 
 		 147 aa  101  4e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.001025  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01683  hypothetical protein  34.51 
 
 		 151 aa  94.7  5e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0790342  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1146  hemerythrin HHE cation binding region  36.92 
 
 		 146 aa  94  8e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.184168  normal  0.471523 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001938  hypothetical protein  36.64 
 
 		 143 aa  89  2e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0691  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  35.38 
 
 		 147 aa  84.7  5e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2773  hypothetical protein  32.88 
 
 		 147 aa  84.7  5e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0249473  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2501  hemerythrin  33.33 
 
 		 160 aa  82.8  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3570  hemerythrin HHE cation binding region  32.61 
 
 		 145 aa  82  0.000000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.499938 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3909  hemerythrin HHE cation binding region  36.23 
 
 		 147 aa  78.2  0.00000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.288591  normal  0.315835 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0340  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  31.39 
 
 		 159 aa  74.3  0.0000000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000991487  hitchhiker  0.00000000430115 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0362  hypothetical protein  29.93 
 
 		 162 aa  71.6  0.000000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1182  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  29.86 
 
 		 148 aa  68.6  0.00000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.900555  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2004  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  32.89 
 
 		 151 aa  67.8  0.00000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3465  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  32.41 
 
 		 147 aa  66.6  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.15554  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5558  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  31.51 
 
 		 188 aa  61.2  0.000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.418641 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0146  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  27.81 
 
 		 171 aa  57.8  0.00000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.613584  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0996  hypothetical protein  31.29 
 
 		 169 aa  57.4  0.00000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.457689  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0129  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  27.15 
 
 		 171 aa  57  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7183  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  29.19 
 
 		 190 aa  53.5  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4534  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  24.82 
 
 		 345 aa  48.1  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2543  hypothetical protein  28.67 
 
 		 216 aa  47.4  0.00009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.771916  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2793  Hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  28.57 
 
 		 185 aa  44.7  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0769418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1828  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  26.62 
 
 		 145 aa  43.1  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4867  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  30.1 
 
 		 158 aa  43.1  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00231267  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1807  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  27.59 
 
 		 194 aa  42  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0985875  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0603  hemerythrin HHE cation binding region  29.93 
 
 		 154 aa  42  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.499729  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4096  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  26.87 
 
 		 183 aa  41.6  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.100934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5288  hemerythrin HHE cation binding region  29.31 
 
 		 152 aa  41.6  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5377  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  29.31 
 
 		 152 aa  41.6  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.246335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5667  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  29.31 
 
 		 152 aa  41.6  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.544539  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2540  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  29.91 
 
 		 155 aa  40.8  0.008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0733  hypothetical protein  29.37 
 
 		 195 aa  40.4  0.009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.21283  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>