32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_4086 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008228  Patl_4086  hemerythrin HHE cation binding region  100 
 
 
146 aa  295  2e-79  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01683  hypothetical protein  60.14 
 
 
151 aa  175  1e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0790342  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001938  hypothetical protein  57.97 
 
 
143 aa  162  1.0000000000000001e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2773  hypothetical protein  57.34 
 
 
147 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0249473  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3570  hemerythrin HHE cation binding region  55.94 
 
 
145 aa  160  6e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.499938 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2501  hemerythrin  56.64 
 
 
160 aa  160  7e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1146  hemerythrin HHE cation binding region  52.94 
 
 
146 aa  155  1e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.184168  normal  0.471523 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2777  hemerythrin HHE cation binding protein  53.9 
 
 
145 aa  155  1e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0691  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  54.41 
 
 
147 aa  147  4e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3909  hemerythrin HHE cation binding region  51.37 
 
 
147 aa  134  5e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.288591  normal  0.315835 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3465  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  51.39 
 
 
147 aa  127  6e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.15554  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0362  hypothetical protein  44.44 
 
 
162 aa  116  9.999999999999999e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0340  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  45.26 
 
 
159 aa  110  9e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000991487  hitchhiker  0.00000000430115 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4394  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  38.13 
 
 
147 aa  104  4e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.001025  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2188  hemerythrin HHE cation binding region  36.3 
 
 
162 aa  103  1e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2004  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  39.26 
 
 
151 aa  102  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0996  hypothetical protein  39.13 
 
 
169 aa  94  6e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.457689  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1182  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  36.59 
 
 
148 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.900555  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0129  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  30.07 
 
 
171 aa  73.2  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0146  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  29.37 
 
 
171 aa  72  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.613584  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1828  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  28.99 
 
 
145 aa  52.4  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5558  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  23.44 
 
 
188 aa  47  0.00008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.418641 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2793  Hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  27.43 
 
 
185 aa  45.8  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0769418  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00370  hypothetical protein  29.27 
 
 
196 aa  45.1  0.0003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.284993 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2831  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  34.48 
 
 
184 aa  44.7  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1764  hypothetical protein  26.47 
 
 
150 aa  44.3  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4773  hypothetical protein  32.04 
 
 
190 aa  43.1  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1827  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  25.55 
 
 
149 aa  42  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08638  HHE domain protein (AFU_orthologue; AFUA_4G00730)  24.29 
 
 
228 aa  40.8  0.007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000349477  normal  0.759451 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4867  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  25.17 
 
 
158 aa  40.4  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00231267  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00300  hemerythrin HHE cation binding protein  29.03 
 
 
157 aa  40  0.01  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3800  Hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  32.63 
 
 
187 aa  40  0.01  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000606803 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>