35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_001938 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_001938  hypothetical protein  100 
 
 		 143 aa  292  1e-78  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01683  hypothetical protein  63.77 
 
 		 151 aa  183  9e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0790342  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2501  hemerythrin  57.25 
 
 		 160 aa  167  3e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3570  hemerythrin HHE cation binding region  57.25 
 
 		 145 aa  165  2e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.499938 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2773  hypothetical protein  57.25 
 
 		 147 aa  164  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0249473  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1146  hemerythrin HHE cation binding region  55.15 
 
 		 146 aa  163  5.9999999999999996e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.184168  normal  0.471523 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4086  hemerythrin HHE cation binding region  57.97 
 
 		 146 aa  162  1.0000000000000001e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2777  hemerythrin HHE cation binding protein  51.8 
 
 		 145 aa  149  1e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3909  hemerythrin HHE cation binding region  57.45 
 
 		 147 aa  147  7e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.288591  normal  0.315835 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0691  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  49.26 
 
 		 147 aa  137  4.999999999999999e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3465  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  54.61 
 
 		 147 aa  135  3.0000000000000003e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.15554  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0362  hypothetical protein  41.84 
 
 		 162 aa  107  7.000000000000001e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4394  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  37.86 
 
 		 147 aa  103  1e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.001025  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2004  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  39.26 
 
 		 151 aa  102  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0340  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  41.91 
 
 		 159 aa  102  2e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000991487  hitchhiker  0.00000000430115 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0996  hypothetical protein  41.43 
 
 		 169 aa  100  9e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.457689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2188  hemerythrin HHE cation binding region  36.64 
 
 		 162 aa  89  2e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0129  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  33.08 
 
 		 171 aa  74.3  0.0000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0146  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  32.33 
 
 		 171 aa  72.4  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.613584  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1182  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  33.33 
 
 		 148 aa  70.9  0.000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.900555  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1791  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  32.77 
 
 		 346 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.482606  normal  0.753058 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2793  Hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  26.47 
 
 		 185 aa  51.6  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0769418  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1764  hypothetical protein  28.57 
 
 		 150 aa  48.9  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1827  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  29.29 
 
 		 149 aa  49.3  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1828  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  26.43 
 
 		 145 aa  45.8  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3897  hemerythrin HHE cation binding region  28.45 
 
 		 351 aa  45.4  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.65028  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2678  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  28.57 
 
 		 187 aa  44.7  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.027018 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4773  hypothetical protein  28.85 
 
 		 190 aa  43.9  0.0007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00300  hemerythrin HHE cation binding protein  31.62 
 
 		 157 aa  42.7  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1486  hemerythrin HHE cation binding region  28.87 
 
 		 168 aa  42.4  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3326  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  31.71 
 
 		 207 aa  42.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4534  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  26.56 
 
 		 345 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7183  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  27.56 
 
 		 190 aa  41.6  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0733  hypothetical protein  26.72 
 
 		 195 aa  40.4  0.009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.21283  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1490  hemerythrin hhE cation-binding domain-containing protein  23.53 
 
 		 351 aa  40  0.009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>