75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1827 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_1827  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  100 
 
 
149 aa  299  1e-80  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1182  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  33.33 
 
 
148 aa  77  0.00000000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.900555  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0129  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  29.17 
 
 
171 aa  70.1  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5414  hypothetical protein  33.79 
 
 
157 aa  68.6  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0146  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  28.47 
 
 
171 aa  67.8  0.00000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.613584  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01683  hypothetical protein  30.34 
 
 
151 aa  67.4  0.00000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0790342  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4867  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  31.25 
 
 
158 aa  66.6  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00231267  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1828  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  23.74 
 
 
145 aa  64.7  0.0000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1764  hypothetical protein  29.86 
 
 
150 aa  63.9  0.0000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2304  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  34.93 
 
 
155 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.49085  hitchhiker  0.00000533583 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001938  hypothetical protein  29.29 
 
 
143 aa  63.5  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4534  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  30.71 
 
 
345 aa  61.2  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0069  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  34.69 
 
 
158 aa  60.5  0.000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0077  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  34.69 
 
 
158 aa  59.7  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.556159 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4394  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  30.07 
 
 
147 aa  60.1  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.001025  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2501  hemerythrin  29.29 
 
 
160 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2404  hemerythrin HHE cation binding region  36.3 
 
 
158 aa  57  0.00000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00792518 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2773  hypothetical protein  28.47 
 
 
147 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0249473  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1868  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  28.28 
 
 
144 aa  55.8  0.0000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00300  hemerythrin HHE cation binding protein  32.79 
 
 
157 aa  55.1  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2549  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  33.82 
 
 
165 aa  55.1  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4086  hemerythrin HHE cation binding region  25.55 
 
 
146 aa  55.5  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2453  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  33.82 
 
 
165 aa  54.7  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.217194  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0362  hypothetical protein  26.43 
 
 
162 aa  55.1  0.0000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4750  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  29.8 
 
 
190 aa  54.3  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.777475  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0691  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  30.23 
 
 
147 aa  52.8  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3007  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  35.17 
 
 
154 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.442011  normal  0.933539 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4614  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  31.58 
 
 
185 aa  53.1  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.178279  normal  0.138326 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2776  Hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  29.17 
 
 
184 aa  53.5  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.1725  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3570  hemerythrin HHE cation binding region  27.89 
 
 
145 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.499938 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2860  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  35.17 
 
 
154 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.184327  normal  0.243367 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7183  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  28.08 
 
 
190 aa  52.4  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1404  hemerythrin HHE cation binding protein  34.56 
 
 
165 aa  51.6  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0340  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  26.09 
 
 
159 aa  51.2  0.000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000991487  hitchhiker  0.00000000430115 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0180  hemerythrin HHE cation binding region protein  29.09 
 
 
166 aa  51.2  0.000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1791  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  26.39 
 
 
346 aa  51.2  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.482606  normal  0.753058 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2777  hemerythrin HHE cation binding protein  28.26 
 
 
145 aa  51.2  0.000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1486  hemerythrin HHE cation binding region  30.82 
 
 
168 aa  50.8  0.000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2426  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  35.34 
 
 
163 aa  50.8  0.000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.13977  normal  0.0393648 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2188  hemerythrin HHE cation binding region  24.48 
 
 
162 aa  50.8  0.000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0324  hypothetical cytosolic protein  27.59 
 
 
144 aa  50.8  0.000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36520  hypothetical protein  32.88 
 
 
156 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00150219  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2548  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  26.03 
 
 
190 aa  50.1  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3032  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  33.79 
 
 
154 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3504  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  25.64 
 
 
271 aa  48.9  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.033907  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2248  hypothetical protein  28.46 
 
 
161 aa  49.3  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2722  hemerythrin HHE cation binding domain protein  32.88 
 
 
154 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08638  HHE domain protein (AFU_orthologue; AFUA_4G00730)  29.29 
 
 
228 aa  48.5  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000349477  normal  0.759451 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3879  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  37.66 
 
 
165 aa  48.5  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1675  hemerythrin hhE cation binding domain-containing protein  25 
 
 
193 aa  48.1  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.974431  normal  0.386222 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6540  cyclase/dehydrase  27.27 
 
 
287 aa  48.1  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.472702  normal  0.0557794 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3133  hypothetical protein  31.97 
 
 
156 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.682098  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2678  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  24.31 
 
 
187 aa  47.4  0.00007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.027018 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1146  hemerythrin HHE cation binding region  27.74 
 
 
146 aa  47  0.00008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.184168  normal  0.471523 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2007  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  29.31 
 
 
164 aa  47  0.00008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0996  hypothetical protein  28.87 
 
 
169 aa  47  0.00008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.457689  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1490  hemerythrin hhE cation-binding domain-containing protein  28.26 
 
 
351 aa  45.4  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2146  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  21.01 
 
 
350 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.460261 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2168  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  27.46 
 
 
188 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4302  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  23.68 
 
 
171 aa  44.7  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0733  hypothetical protein  26.77 
 
 
195 aa  44.3  0.0005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.21283  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5496  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  27.21 
 
 
184 aa  43.9  0.0007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4679  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  23.91 
 
 
235 aa  43.9  0.0007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1421  hemerythrin HHE cation binding region protein  24.82 
 
 
178 aa  43.9  0.0008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3897  hemerythrin HHE cation binding region  23.19 
 
 
351 aa  43.5  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.65028  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1807  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  22.97 
 
 
194 aa  43.1  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0985875  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4535  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  21.99 
 
 
179 aa  42.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.739296  normal  0.620598 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2004  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  24.11 
 
 
151 aa  42.4  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4228  hemerythrin HHE cation binding region  24.31 
 
 
196 aa  42  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2908  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  26.27 
 
 
147 aa  41.6  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.152299  normal  0.240575 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2070  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  25.81 
 
 
185 aa  41.2  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000612385  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5558  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  26.21 
 
 
188 aa  40.8  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.418641 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2543  hypothetical protein  25 
 
 
216 aa  40.4  0.008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.771916  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1017  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  26.71 
 
 
167 aa  40.4  0.008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0603  hemerythrin HHE cation binding region  32.5 
 
 
154 aa  40.4  0.008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.499729  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>