75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_2860 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_2860  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  100 
 
 		 154 aa  299  8.000000000000001e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.184327  normal  0.243367 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3007  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  91.56 
 
 		 154 aa  250  5.000000000000001e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.442011  normal  0.933539 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3032  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  88.96 
 
 		 154 aa  242  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2722  hemerythrin HHE cation binding domain protein  88.96 
 
 		 154 aa  241  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2304  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  64.52 
 
 		 155 aa  168  3e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.49085  hitchhiker  0.00000533583 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36520  hypothetical protein  69.87 
 
 		 156 aa  167  4e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00150219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3133  hypothetical protein  69.23 
 
 		 156 aa  167  7e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.682098  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2404  hemerythrin HHE cation binding region  67.57 
 
 		 158 aa  166  8e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00792518 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00300  hemerythrin HHE cation binding protein  54.05 
 
 		 157 aa  142  2e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5414  hypothetical protein  37.59 
 
 		 157 aa  79.3  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2248  hypothetical protein  38.56 
 
 		 161 aa  78.2  0.00000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4867  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  37.16 
 
 		 158 aa  77  0.00000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00231267  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1486  hemerythrin HHE cation binding region  36.67 
 
 		 168 aa  71.2  0.000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4614  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  38.21 
 
 		 185 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.178279  normal  0.138326 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0069  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  33.78 
 
 		 158 aa  69.7  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0077  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  33.78 
 
 		 158 aa  69.3  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.556159 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0180  hemerythrin HHE cation binding region protein  39.66 
 
 		 166 aa  66.2  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5558  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  31.65 
 
 		 188 aa  66.6  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.418641 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3879  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  32.69 
 
 		 165 aa  65.5  0.0000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0603  hemerythrin HHE cation binding region  34.9 
 
 		 154 aa  66.2  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.499729  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2007  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  34.39 
 
 		 164 aa  65.5  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0733  hypothetical protein  34.71 
 
 		 195 aa  64.3  0.0000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.21283  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4232  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  35.29 
 
 		 178 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1404  hemerythrin HHE cation binding protein  39.72 
 
 		 165 aa  63.9  0.0000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3504  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  26.11 
 
 		 271 aa  63.9  0.0000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.033907  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2549  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  38.3 
 
 		 165 aa  62.8  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2453  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  38.3 
 
 		 165 aa  62.8  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.217194  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1182  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  33.79 
 
 		 148 aa  62.4  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.900555  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2426  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  39.72 
 
 		 163 aa  62.4  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.13977  normal  0.0393648 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4302  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  32.48 
 
 		 171 aa  59.3  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7183  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  33.11 
 
 		 190 aa  58.9  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0129  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  27.95 
 
 		 171 aa  59.7  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2480  hypothetical protein  35.14 
 
 		 177 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0435976  normal  0.540036 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4534  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  25 
 
 		 345 aa  58.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2534  hypothetical protein  31.06 
 
 		 495 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.715554  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3973  hypothetical protein  86 
 
 		 50 aa  58.5  0.00000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.124071 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1421  hemerythrin HHE cation binding region protein  34.64 
 
 		 178 aa  57.8  0.00000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2719  hypothetical protein  33.08 
 
 		 407 aa  57.8  0.00000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5496  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  31.71 
 
 		 184 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0146  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  26.71 
 
 		 171 aa  56.6  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.613584  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1791  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  26.28 
 
 		 346 aa  55.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.482606  normal  0.753058 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4394  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  31.29 
 
 		 147 aa  55.5  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.001025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1827  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  35.17 
 
 		 149 aa  55.1  0.0000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2776  Hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  28.57 
 
 		 184 aa  54.3  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.1725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4535  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  31.25 
 
 		 179 aa  54.3  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.739296  normal  0.620598 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3897  hemerythrin HHE cation binding region  25 
 
 		 351 aa  52.4  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.65028  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1490  hemerythrin hhE cation-binding domain-containing protein  28.19 
 
 		 351 aa  51.6  0.000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2548  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  28.28 
 
 		 190 aa  50.8  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12652  hypothetical protein  30.46 
 
 		 161 aa  48.9  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  4.33287e-35  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1314  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  28.97 
 
 		 190 aa  48.1  0.00005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3837  hypothetical protein  27.27 
 
 		 445 aa  47.8  0.00006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0111576  normal  0.104463 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2008  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  30.46 
 
 		 202 aa  47.4  0.00008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3822  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  30.71 
 
 		 482 aa  47  0.00009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.690759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0691  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  29.46 
 
 		 147 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4679  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  29.29 
 
 		 235 aa  46.6  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5327  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  24.68 
 
 		 347 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0858  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  37.17 
 
 		 186 aa  45.1  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1807  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  26.17 
 
 		 194 aa  45.1  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0985875  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2188  hemerythrin HHE cation binding region  30.65 
 
 		 162 aa  43.9  0.0007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1146  hemerythrin HHE cation binding region  29.77 
 
 		 146 aa  43.9  0.0008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.184168  normal  0.471523 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2777  hemerythrin HHE cation binding protein  29.46 
 
 		 145 aa  43.9  0.0009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001938  hypothetical protein  28.12 
 
 		 143 aa  43.9  0.0009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0685  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  26.19 
 
 		 187 aa  43.5  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.434426  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2678  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  26.87 
 
 		 187 aa  43.5  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.027018 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2146  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  24.5 
 
 		 350 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.460261 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0478  hypothetical protein  31.4 
 
 		 174 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0362  hypothetical protein  29.55 
 
 		 162 aa  42.7  0.002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1891  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  26.58 
 
 		 152 aa  42.4  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1066  hemerythrin HHE cation binding region  27.59 
 
 		 154 aa  42.7  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.602871  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1675  hemerythrin hhE cation binding domain-containing protein  33.33 
 
 		 193 aa  42  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.974431  normal  0.386222 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0340  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  28.89 
 
 		 159 aa  42  0.003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000991487  hitchhiker  0.00000000430115 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0473  hypothetical protein  31.76 
 
 		 174 aa  41.2  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.499498  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4086  hemerythrin HHE cation binding region  25.58 
 
 		 146 aa  40.8  0.007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2304  putative regulator of cell morphogenesis and NO signaling  30.77 
 
 		 162 aa  40.4  0.008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.904148  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3999  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  25.52 
 
 		 202 aa  40.4  0.01  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>