72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_3133 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_3133  hypothetical protein  100 
 
 
156 aa  304  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.682098  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36520  hypothetical protein  92.95 
 
 
156 aa  230  5e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00150219  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2860  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  69.23 
 
 
154 aa  180  8.000000000000001e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.184327  normal  0.243367 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3007  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  71.15 
 
 
154 aa  179  1e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.442011  normal  0.933539 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2722  hemerythrin HHE cation binding domain protein  68.59 
 
 
154 aa  176  8e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2404  hemerythrin HHE cation binding region  66.89 
 
 
158 aa  173  8e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00792518 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3032  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  66.03 
 
 
154 aa  171  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2304  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  61.49 
 
 
155 aa  160  6e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.49085  hitchhiker  0.00000533583 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00300  hemerythrin HHE cation binding protein  53.5 
 
 
157 aa  148  4e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5414  hypothetical protein  39.44 
 
 
157 aa  87  9e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2248  hypothetical protein  36.08 
 
 
161 aa  85.9  2e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4867  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  36 
 
 
158 aa  80.9  0.000000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00231267  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1182  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  37.84 
 
 
148 aa  80.5  0.000000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.900555  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1486  hemerythrin HHE cation binding region  33.56 
 
 
168 aa  72.4  0.000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0069  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  35.37 
 
 
158 aa  72  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0077  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  35.37 
 
 
158 aa  71.2  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.556159 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4302  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  36.31 
 
 
171 aa  71.2  0.000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2007  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  38.28 
 
 
164 aa  70.9  0.000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0733  hypothetical protein  33.99 
 
 
195 aa  70.1  0.00000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.21283  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3879  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  35.16 
 
 
165 aa  69.7  0.00000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4614  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  33.77 
 
 
185 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.178279  normal  0.138326 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0180  hemerythrin HHE cation binding region protein  39.37 
 
 
166 aa  68.2  0.00000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7183  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  34.21 
 
 
190 aa  65.1  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0603  hemerythrin HHE cation binding region  36.57 
 
 
154 aa  63.5  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.499729  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4534  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  23.53 
 
 
345 aa  62  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5496  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  31.21 
 
 
184 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2453  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  38.03 
 
 
165 aa  59.7  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.217194  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1404  hemerythrin HHE cation binding protein  40.14 
 
 
165 aa  59.7  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4232  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  32.45 
 
 
178 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2549  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  38.03 
 
 
165 aa  59.3  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1421  hemerythrin HHE cation binding region protein  35.1 
 
 
178 aa  58.9  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5558  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  29.37 
 
 
188 aa  59.7  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.418641 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3897  hemerythrin HHE cation binding region  25.81 
 
 
351 aa  58.5  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.65028  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4535  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  31.41 
 
 
179 aa  58.5  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.739296  normal  0.620598 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0129  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  29.68 
 
 
171 aa  58.2  0.00000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2426  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  38 
 
 
163 aa  58.2  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.13977  normal  0.0393648 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1791  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  27.15 
 
 
346 aa  58.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.482606  normal  0.753058 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4394  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  33.11 
 
 
147 aa  57.4  0.00000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.001025  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2480  hypothetical protein  32.45 
 
 
177 aa  57.4  0.00000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0435976  normal  0.540036 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2548  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  28.19 
 
 
190 aa  54.7  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0146  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  28.39 
 
 
171 aa  54.3  0.0000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.613584  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3504  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  24.84 
 
 
271 aa  53.9  0.0000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.033907  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1827  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  31.97 
 
 
149 aa  53.5  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1490  hemerythrin hhE cation-binding domain-containing protein  26.62 
 
 
351 aa  52.8  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1314  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  30.92 
 
 
190 aa  52.4  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2534  hypothetical protein  33.63 
 
 
495 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.715554  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2678  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  28.76 
 
 
187 aa  50.8  0.000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.027018 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2776  Hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  28.21 
 
 
184 aa  50.4  0.000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.1725  normal 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3822  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  32.2 
 
 
482 aa  50.1  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.690759  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2777  hemerythrin HHE cation binding protein  30.2 
 
 
145 aa  50.1  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0691  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  31.36 
 
 
147 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1807  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  26.14 
 
 
194 aa  49.3  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0985875  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5327  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  24.05 
 
 
347 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1868  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  25.85 
 
 
144 aa  49.3  0.00002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2719  hypothetical protein  31.71 
 
 
407 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01683  hypothetical protein  31.72 
 
 
151 aa  46.2  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0790342  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12652  hypothetical protein  30.99 
 
 
161 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  4.33287e-35  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4679  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  33.08 
 
 
235 aa  46.2  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0858  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  35.71 
 
 
186 aa  45.1  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001938  hypothetical protein  33.07 
 
 
143 aa  45.4  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2146  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  24.84 
 
 
350 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.460261 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3837  hypothetical protein  27.12 
 
 
445 aa  44.7  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0111576  normal  0.104463 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1146  hemerythrin HHE cation binding region  30.43 
 
 
146 aa  44.7  0.0005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.184168  normal  0.471523 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4228  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  23.81 
 
 
233 aa  44.3  0.0007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0324  hypothetical cytosolic protein  24.49 
 
 
144 aa  43.9  0.0009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0340  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  29.41 
 
 
159 aa  43.1  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000991487  hitchhiker  0.00000000430115 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4086  hemerythrin HHE cation binding region  27.34 
 
 
146 aa  42.7  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3570  hemerythrin HHE cation binding region  30.32 
 
 
145 aa  42  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.499938 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1891  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  24.84 
 
 
152 aa  41.6  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2773  hypothetical protein  28.19 
 
 
147 aa  41.2  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0249473  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08638  HHE domain protein (AFU_orthologue; AFUA_4G00730)  25.32 
 
 
228 aa  41.2  0.005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000349477  normal  0.759451 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0685  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  24.69 
 
 
187 aa  40.8  0.007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.434426  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>