73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_3007 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_3007  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  100 
 
 		 154 aa  298  3e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.442011  normal  0.933539 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2860  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  91.56 
 
 		 154 aa  249  7e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.184327  normal  0.243367 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3032  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  87.01 
 
 		 154 aa  237  4e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2722  hemerythrin HHE cation binding domain protein  87.01 
 
 		 154 aa  236  6.999999999999999e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2404  hemerythrin HHE cation binding region  69.59 
 
 		 158 aa  171  5e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00792518 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3133  hypothetical protein  71.15 
 
 		 156 aa  166  1e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.682098  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36520  hypothetical protein  71.15 
 
 		 156 aa  166  1e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00150219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2304  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  61.94 
 
 		 155 aa  160  8.000000000000001e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.49085  hitchhiker  0.00000533583 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00300  hemerythrin HHE cation binding protein  54.14 
 
 		 157 aa  142  2e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5414  hypothetical protein  39.01 
 
 		 157 aa  79.7  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2248  hypothetical protein  37.8 
 
 		 161 aa  76.3  0.0000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4867  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  35.17 
 
 		 158 aa  75.5  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00231267  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0069  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  34.46 
 
 		 158 aa  73.2  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0077  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  34.46 
 
 		 158 aa  73.6  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.556159 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4614  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  39.02 
 
 		 185 aa  72  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.178279  normal  0.138326 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1486  hemerythrin HHE cation binding region  36.99 
 
 		 168 aa  71.6  0.000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4232  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  36.6 
 
 		 178 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2007  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  35.29 
 
 		 164 aa  66.6  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0733  hypothetical protein  35.54 
 
 		 195 aa  66.2  0.0000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.21283  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0603  hemerythrin HHE cation binding region  34.23 
 
 		 154 aa  65.9  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.499729  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3879  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  32.81 
 
 		 165 aa  65.5  0.0000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1182  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  34.48 
 
 		 148 aa  65.1  0.0000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.900555  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5558  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  30.94 
 
 		 188 aa  65.1  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.418641 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0180  hemerythrin HHE cation binding region protein  38.46 
 
 		 166 aa  64.7  0.0000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2549  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  39.01 
 
 		 165 aa  64.3  0.0000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2480  hypothetical protein  38 
 
 		 177 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0435976  normal  0.540036 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2453  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  39.01 
 
 		 165 aa  63.9  0.0000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.217194  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1404  hemerythrin HHE cation binding protein  40.43 
 
 		 165 aa  63.9  0.0000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3504  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  26.11 
 
 		 271 aa  63.9  0.0000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.033907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2426  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  37.66 
 
 		 163 aa  61.6  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.13977  normal  0.0393648 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3973  hypothetical protein  82.35 
 
 		 50 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.124071 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4302  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  32.68 
 
 		 171 aa  58.2  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2719  hypothetical protein  33.08 
 
 		 407 aa  57.8  0.00000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2534  hypothetical protein  33.85 
 
 		 495 aa  57.4  0.00000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.715554  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1421  hemerythrin HHE cation binding region protein  34 
 
 		 178 aa  57.4  0.00000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4394  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  31.58 
 
 		 147 aa  57  0.00000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.001025  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5496  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  30.89 
 
 		 184 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7183  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  32.43 
 
 		 190 aa  56.6  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0129  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  25.97 
 
 		 171 aa  56.6  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4534  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  24.32 
 
 		 345 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1827  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  35.17 
 
 		 149 aa  55.8  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1791  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  26.28 
 
 		 346 aa  55.5  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.482606  normal  0.753058 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0146  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  24.68 
 
 		 171 aa  53.1  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.613584  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2776  Hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  29.53 
 
 		 184 aa  52.4  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.1725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4535  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  30.34 
 
 		 179 aa  52  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.739296  normal  0.620598 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3897  hemerythrin HHE cation binding region  25.55 
 
 		 351 aa  50.8  0.000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.65028  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1490  hemerythrin hhE cation-binding domain-containing protein  29.71 
 
 		 351 aa  50.4  0.000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1314  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  30.52 
 
 		 190 aa  50.4  0.000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2548  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  28.47 
 
 		 190 aa  50.4  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12652  hypothetical protein  30.46 
 
 		 161 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  4.33287e-35  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2008  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  31.13 
 
 		 202 aa  48.1  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3822  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  31.36 
 
 		 482 aa  47.8  0.00005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.690759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4679  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  30 
 
 		 235 aa  46.6  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0691  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  28.68 
 
 		 147 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3837  hypothetical protein  26.62 
 
 		 445 aa  45.1  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0111576  normal  0.104463 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2188  hemerythrin HHE cation binding region  29.17 
 
 		 162 aa  45.4  0.0003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1146  hemerythrin HHE cation binding region  29.77 
 
 		 146 aa  45.1  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.184168  normal  0.471523 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5327  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  23.38 
 
 		 347 aa  43.9  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2777  hemerythrin HHE cation binding protein  27.21 
 
 		 145 aa  43.9  0.0007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2678  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  27.61 
 
 		 187 aa  43.9  0.0008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.027018 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001938  hypothetical protein  28.12 
 
 		 143 aa  43.5  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0858  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  36.28 
 
 		 186 aa  43.1  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3999  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  25.52 
 
 		 202 aa  42.7  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1807  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  24.83 
 
 		 194 aa  42.4  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0985875  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0685  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  28.29 
 
 		 187 aa  42.4  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.434426  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0478  hypothetical protein  32.56 
 
 		 174 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0547  hemerythrin HHE cation binding protein  27.91 
 
 		 178 aa  43.1  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.184109  normal  0.0988011 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1891  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  27.22 
 
 		 152 aa  42.7  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2146  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  25.41 
 
 		 350 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.460261 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4086  hemerythrin HHE cation binding region  25.19 
 
 		 146 aa  41.6  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0340  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  28.15 
 
 		 159 aa  41.2  0.005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000991487  hitchhiker  0.00000000430115 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0362  hypothetical protein  29.1 
 
 		 162 aa  41.2  0.006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0473  hypothetical protein  31.91 
 
 		 174 aa  40.8  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.499498  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>