38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_0340 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_0340  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  100 
 
 		 159 aa  323  6e-88  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000991487  hitchhiker  0.00000000430115 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0362  hypothetical protein  72.15 
 
 		 162 aa  241  3.9999999999999997e-63  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2501  hemerythrin  51.66 
 
 		 160 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2773  hypothetical protein  55.32 
 
 		 147 aa  144  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0249473  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3570  hemerythrin HHE cation binding region  55.07 
 
 		 145 aa  142  2e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.499938 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0691  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  49.31 
 
 		 147 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1146  hemerythrin HHE cation binding region  46.81 
 
 		 146 aa  121  4e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.184168  normal  0.471523 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2777  hemerythrin HHE cation binding protein  44.53 
 
 		 145 aa  111  3e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4086  hemerythrin HHE cation binding region  45.26 
 
 		 146 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001938  hypothetical protein  41.91 
 
 		 143 aa  102  2e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0996  hypothetical protein  44.97 
 
 		 169 aa  102  3e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.457689  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01683  hypothetical protein  41.61 
 
 		 151 aa  101  4e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0790342  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2004  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  36.49 
 
 		 151 aa  95.1  3e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3909  hemerythrin HHE cation binding region  42.03 
 
 		 147 aa  82.4  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.288591  normal  0.315835 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3465  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  46.34 
 
 		 147 aa  80.5  0.000000000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.15554  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2188  hemerythrin HHE cation binding region  31.39 
 
 		 162 aa  74.3  0.0000000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4394  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  29.93 
 
 		 147 aa  65.1  0.0000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.001025  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1182  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  30.4 
 
 		 148 aa  64.7  0.0000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.900555  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5558  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  29.41 
 
 		 188 aa  60.1  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.418641 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7183  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  32 
 
 		 190 aa  57.8  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0129  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  30.66 
 
 		 171 aa  54.3  0.0000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4302  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  33.33 
 
 		 171 aa  52  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0146  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  30.15 
 
 		 171 aa  52.4  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.613584  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2678  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  27.41 
 
 		 187 aa  49.3  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.027018 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4867  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  29.69 
 
 		 158 aa  48.5  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00231267  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2831  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  31.78 
 
 		 184 aa  47.8  0.00007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2548  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  29.17 
 
 		 190 aa  47  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2793  Hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  28 
 
 		 185 aa  45.4  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0769418  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1807  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  30.43 
 
 		 194 aa  44.7  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0985875  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1314  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  28.07 
 
 		 190 aa  44.7  0.0006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1066  hemerythrin HHE cation binding region  25.9 
 
 		 154 aa  44.3  0.0007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.602871  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00370  hypothetical protein  29.41 
 
 		 196 aa  43.1  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.284993 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0733  hypothetical protein  29.69 
 
 		 195 aa  41.6  0.005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.21283  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2543  hypothetical protein  32.77 
 
 		 216 aa  41.2  0.005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.771916  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4614  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  31.11 
 
 		 185 aa  41.6  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.178279  normal  0.138326 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3326  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  29.17 
 
 		 207 aa  41.2  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5496  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  30.71 
 
 		 184 aa  41.2  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4534  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  23.81 
 
 		 345 aa  40.8  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>